Нарисуйте упрощенное филогенетическое дерево для детей.

Мне нужно нарисовать простое филогенетическое дерево для детской лекции.

Я ищу онлайн-инструмент, в котором я могу ввести организмы (например, человека, осу, грибок) и получить фигуру филогенетического дерева. Дерево должно быть основано на том, насколько близки эти организмы (мне не нужно выравнивание генома).

Подобный инструмент для изготовления фигурок был бы идеальным.## Заголовок ##

Просто загрузите существующую диаграмму. Чтобы создать дерево, вам нужно будет вставить эталонные последовательности.
Взгляните на этот веб-сайт. Это может быть полезно.
@WYSIWYG, где я могу это сделать?
Вы можете найти изображения деревьев с помощью поиска Google... но если вы хотите сделать дерево самостоятельно, вам понадобится некоторая эталонная последовательность. Для этого не используется весь геном, но часто используются некоторые последовательности, такие как 18s рРНК. Выполнение выравнивания неизбежно, но алгоритмы (такие как clustalW) делают это скрытно.
вы можете использовать itol.embl.de для получения деревьев на основе таксономии NCBI, но вам придется использовать графическую программу, чтобы сделать их красивее

Ответы (2)

В соответствии с вашими требованиями я предложу:

http://www.onezoom.org/

Я не знаю, какую подготовку вы дали детям или какой уровень, но вот кое-что, что мы делаем на неспециальном курсе биологии для первокурсников, и это можно легко изменить. Во-первых, чтобы заставить их задуматься о деревьях и отношениях, дайте им простую семейную генеалогию (для простоты используйте только одного родителя). Я использую свое генеалогическое древо, восходящее к моей бабушке. С кузенами, тетями, братьями и сестрами они начинают понимать, как интерпретировать родословные. Вы можете заменить названия семейств названиями организмов, чтобы получить базовое филогенетическое дерево.

Мы учим строить деревья просто. Мы даем учащимся список из шести видов (фальшивых птиц) с последовательностями ДНК длиной всего 20 нуклеотидов. Студенты должны подсчитать количество различий в паре оснований между каждой парой последовательностей, которые в нашем случае находятся в диапазоне от 2 до 10 нуклеотидов.

Затем они используют попарные различия для построения своего дерева, понимая, что меньшее количество нуклеотидных различий между организмами означает, что они более тесно связаны между собой.

Вы можете заниматься этим видом деятельности в течение нескольких дней (в зависимости от времени). Затем вы можете начать показывать им деревья, которые постепенно усложняются. Поскольку дети построили дерево и теперь знают, как оно строится, им будет намного легче интерпретировать более крупные деревья.

Нарисуйте упрощенное филогенетическое дерево для детей.
СпросиСетьПолитика конфиденциальности1y, 0v