Несколько ДНК, одно существо

Предположим, что у вида есть разные наборы ДНК для разных частей его анатомии. Я не предлагаю один набор для каждой функции тела; это привело бы к сотням тысяч уникальных наборов ДНК.

Вместо этого предположим, что существует один набор (основная ДНК), определяющий строение тела, например, положение рук и ног, цвет кожи, форму глаз, количество зубов и т. д.; один набор (функциональная ДНК), который контролировал передачу энергии через тело, будь то через сердечно-сосудистую систему, нервную систему или другой план передачи, заложенный ядром ДНК; и третий набор (трансляционная ДНК), обеспечивающий взаимодействие различных наборов ДНК друг с другом.

Это, безусловно, сложная система, но насколько разумно полагать, что она может существовать, будь то прогрессия природы (предпочтительнее) или инженерия?

Она как бы существует, см. Митохондриальная ДНК .
Я не очень понимаю, что вы имеете в виду. ДНК является опорой генов. Гены более или менее независимы и выполняют определенную задачу. Я думаю, что если мы разберем одну ДНК на гены, не будет различий с разбором нескольких ДНК на гены. Более или менее многомерный массив можно преобразовать в одномерный массив.
@ScottDowney мтДНК — это (небольшая) часть той же ДНК, что и остальная часть тела, а не уникальный набор ДНК. Меня интересует последнее.
Это недавний случай, который может вас заинтересовать: Independent.co.uk/news/science/…
@Kii Кажется, я слышал об этом. Правда страннее вымысла.
@Frostfyre: В масштабах, о которых вы говорите, различие между «одинаковым» и «разным» становится немного размытым. Нити вирусной ДНК реплицируются с использованием клеточных структур человека, но они не человеческие. Митохондриальная ДНК заметно отличается от другой ДНК, используемой в других местах, до такой степени, что утверждается, что митохондрии фактически потреблялись другими одноклеточными организмами до того, как подверглись (теперь очень, очень, долговременному) симбиотическому партнерству.
@Frostfyre, вы говорите о принципиально разных типах ДНК, основанных на разной химии?
@ScottDowney Не другая химия (хотя это было бы интересно), а разные цепочки нуклеотидов.
Должен быть какой-то способ, чтобы все различные наборы ДНК превратились в потомство. В противном случае нет проблем, как показывают ответы. Но подумайте о том, как будет выглядеть репродукция. Кроме того, у людей, вероятно, существуют от сотен до нескольких тысяч независимых генетических регуляторных сетей, что в значительной степени представляет собой сложную версию того, что вы предлагаете. Просто нет веских причин держать ДНК отдельно (особенно потому, что сети частично перекрываются), так что все они основаны на одной и той же ДНК. Конденсация хромосом частично используется для контроля того, какое подмножество используется в каждой клетке.
Они все время открывают внутри вас все больше и больше альтернативной ДНК. Люди грязнее, чем вы думаете. Я думаю, что ваша идея вполне правдоподобна в рамках современных знаний. Боюсь, платный доступ, но может дать вам что-то для поиска: newscientist.com/article/…
@RexKerr Если бы в репродуктивных клетках (яичниках, семенниках, яйцеклетках и сперматозоидах, которые они создают) и в недифференцированных стволовых клетках существовал «основной» набор ДНК, но затем, когда клетки начинают дифференцироваться, определенные пары хромосом могли бы просто быть упал совсем. Скажем, у одной пары хромосом был код образования глаз. Больше нигде в теле он не понадобится, так что его можно будет сбросить со всего, кроме глаз и половых желез. Вопрос в том, достаточна ли экономия от того, чтобы не копировать эту пару хромосом, оправдать механизм управления ею.
@MontyHarder - Действительно. Некоторые организмы в какой-то степени уже делают это в некоторых тканях. (Например, Oxytricha или en.wikipedia.org/wiki/Polytene_chromosome (что, по общему признанию, не так специфично, как вы упомянули).) Обратите внимание, что в биологии существует множество повторных использований, поэтому бит «не нужен» в основном на самом деле не так.

Ответы (12)

Как отметил в своем комментарии Скотт Дауни , это уже происходит у людей .

Если вы ищете что-то более макроскопическое по своей природе: португальский Man-O-War , похоже, довольно эффективно отвечает всем требованиям. Это несколько разных существ ( спасибо Майку Николсу , которые имеют одинаковую ДНК, так что, возможно, это не совсем то, что вам нужно), которые настолько зависят друг от друга, что не могут функционировать независимо.

РЕДАКТИРОВАТЬ: я чувствую себя обязанным указать на ответ QuadmasterXLII на Lichen . Я думаю, что вы ищете что-то в масштабе Man-O-War, но с уровнем симбиоза лишайника (который останавливается перед полной митохондриальной интеграцией, которую мы имеем).

Так что да , это ответ на ваш вопрос. Может случиться, случилось, не стесняйтесь, чтобы это произошло снова.

Можете ли вы дать ссылку на утверждение о том, что зооиды португальских «Мэн-О-Войн» имеют генетические различия? Я не эксперт в этом вопросе, но я считаю, что поскольку каждый зооид в колонии происходит от одного и того же эмбриона, все они генетически идентичны. Ссылка1 Ссылка2 Ссылка3
@MikeNichols: На самом деле вы совершенно правы. Я опускаю голову от стыда и виню в этом неправильно запомненную лекцию по биологии. У меня сложилось впечатление, что зооиды были сначала идентифицированы как отдельные животные из-за их различных генетических моделей, но, похоже, я ошибся! Отредактировано.
Кроме того, женщины. См. тело Барра - примерно половина женских клеток содержит один набор активной ДНК, а другая половина - другой набор. Другая ДНК есть, но деактивирована.
@Mołot: Это хорошо видно у кошек, у которых цвет меха определяется Х-хромосомой. Когда кошка получает два разных гена X рисунка меха, вы получаете странную смесь цветов, известную как «калико», поэтому кошки ситцевой окраски всегда женского пола.
@masonwheeler: это исключительно хороший факт, который я буду вспоминать всякий раз, когда увижу разноцветную дымку!

Лишайник - отличный пример, который точно соответствует тому, что вы описываете. ДНК грибов определяет структуру организма, а ДНК водорослей отвечает за выработку энергии.

Ох! Я забыл Лихена! Молодец, сэр!
Интересно, что теперь кажется вероятным, что лишайники на самом деле представляют собой союз не двух видов (гриб и водоросль), а трех (две разные формы грибов и водоросль).

Это существует в реальном мире: Химеры

На самом деле существуют существа (включая людей), у которых через тело протекают множественные потоки клеточной ДНК. Эти люди (или звери, в зависимости от обстоятельств) называются Химерами .

Тетрагаметный химеризм (или чудовищный химеризм) обычно бывает врожденным и является результатом слияния неидентичных близнецовых зигот. Такие химеры иногда могут иметь несколько наборов половых органов, например, с разным генетическим составом. Обычно это приводит к нестандартному плану тела.

Большинство случаев гораздо более тонкие и приводят к нормальному плану тела, часто остающемуся незамеченным. Были случаи, когда женщины рожали генетически своих сестер или племянниц (потому что генетический материал их собственных матерей или близнецов попал в эмбрион).

Самый известный случай в этом отношении — случай с Лидией Фэирчайлд , которая родила детей, которые, казалось, не были ее генетически, что привело ее к неприятным последствиям в суде, когда она попросила алименты. Позже было показано, что она химера.

Ни один из этих примеров не является настолько специализированным, как то, что вы описываете, но от реальности к вашему примеру не такой большой скачок, как можно было бы ожидать.

Химеры — это только половина ответа (не передается по наследству)

Хотя у химер есть клетки в разных частях тела, содержащие разные геномы, это состояние не передается потомству, поскольку репродукция человека обычно включает только объединение одной клетки от каждого родителя. Таким образом, человеческий ребенок может быть химерой, если сливаются две или более оплодотворенных яйцеклеток, но распределение клеток каждого генома в человеческом теле не будет коррелировать с распределением разных геномов у одного из родителей. Таким образом, это соответствует вашему запросу «множество ДНК, одно существо», но не имеет специализации разных геномов для определенных аспектов тела. Распределение будет в значительной степени случайным и непостоянным от одной химеры к другой.

Наследуемые дивергентные геномы в принципе возможны

Возможно иметь многоклеточное животное, которое не размножается, используя только одну клетку, а вместо этого позволяет всем своим клеткам делиться до тех пор, пока все животное не сможет разделить на две части. Это означает, что специализированный тип клеток у потомства происходит от того же специализированного типа клеток у родителя. Существование этого типа животных означает, что в принципе геном специализированного типа клеток может дрейфовать и существенно отличаться от других типов клеток в том же организме.

Известный нам на Земле пример многоклеточного организма со специализированными клетками, которые размножаются независимо, называется трихоплакс .

Специализированные типы клеток могут расходиться со временем только в том случае, если размножение происходит исключительно путем деления. Это может быть возможно с трихоплаксом, поскольку они, по-видимому, утратили способность к половому размножению (что в противном случае заставило бы все клетки снова иметь один и тот же геном).

Вы можете обнаружить, что линия, которую вы рисуете, более искусственная, чем вы думаете. Идея «множественных ДНК» — это конструкция, облегчающая людям наблюдение за поведением, которое они видят. Когда дело доходит до реальной функции клеток, клетки не заботятся об этой искусственной линии: ДНК есть ДНК.

Рассмотрим вирусную ДНК, которая, судя по нашим наблюдениям, явно принадлежит чужеродному виду. И тем не менее, клетки относятся к этому не иначе. Учтите, что они настолько похожи, что на самом деле время от времени часть вирусной ДНК случайно встраивается в нашу собственную ДНК с помощью механизмов восстановления.

Представьте, что у нас есть 46 уникальных отдельных хромосом, но они состоят из пар, которые достаточно похожи, поэтому мы часто думаем об этом как о 23 парах. И все же мы думаем об этом как об одном геноме.

Учтите, что мы «активируем» разные гены в разных областях. Хотя все клетки имеют примерно одинаковое генетическое содержание, зубы делают зубы тем, что они активизировали выработку белков, необходимых для того, чтобы быть зубами.

Может оказаться, что вы действительно можете грубо разделить наш геном как вашу множественную ДНК, где какая-то ДНК будет заниматься структурой тела, какая-то — зубами и т. д. Однако тело должно решить интересную проблему: как клетка узнает, что она зуб? Частью этого результата является разумное управление процессом деления ранних стволовых клеток, но частью этого является то, что организм устойчив к ошибкам. Вместо «Я — ДНК зуба» вы говорите «Я — тело ДНК, полезное для зубов». Если он активируется в неправильном месте, это может быть хорошо на некоторое время. На самом деле, ген зуба в печени может случайно на некоторое время активироваться, а затем отключиться, когда клетка поймет, что этот ген не очень полезен.

Хотя другие ответы ответили на заголовок вашего вопроса, я не думаю, что кто-то действительно ответил на конкретный вопрос, который вы задали. Может ли организм использовать разные наборы ДНК в разных органах или системах органов? Ответ почти наверняка да, с парой оговорок.

Предостережение 1: Репродуктивным клеткам организма, дающим начало всем остальным клеткам, потребуется полная копия генома каждого органа, иначе геном этого органа, поскольку он не воспроизводит себя, будет потерян. Это означает, что у вашего эмбриона будет вся ДНК, необходимая для создания каждого органа тела, и по мере дифференцировки клеток они будут отбрасывать ДНК, которую больше не используют. Однако клетки зародышевой линии сохранят всю ДНК для следующего поколения.

Предостережение 2: многие гены многоклеточных организмов фактически используются каждой клеткой. Их называют генами домашнего хозяйства, и они отвечают за такие вещи, как базовое содержание клетки. Такие гены, как РНК-полимераза II, рибосомные РНК и комплекс ядерных пор, должны быть в каждой клетке, поэтому ваши разные наборы ДНК будут иметь большое количество перекрытий.

Тем не менее, я не вижу причин, по которым многоклеточный организм не мог бы справиться с дифференцировкой за счет потери ДНК. В настоящее время все организмы, о которых я когда-либо слышал, создают различные типы клеток и органов путем дифференциальной регуляции генов в их ДНК. У них есть миллион способов модулировать работу генов и создавать невероятно сложные регуляторные сети, полные петель обратной связи и бистабильных переключателей. Для сравнения, просто удалить гены, необходимые для того, чтобы быть нейроном, когда вы решите стать глиальной клеткой, кажется довольно простым.

Единственная хитрость заключается в том, что ДНК для различных функций должна быть пространственно разделена в геноме для легкого удаления. Возможно, самый простой способ — по хромосоме. Например, скажем, хромосомы 1, 2 и 3 содержат все вездесущие гены домашнего хозяйства, 4, 5 и 6 содержат гены, специфичные для эктодермы, 7, 8 и 9 содержат мезодермальные факторы, а 10, 11 и 12 необходимы для энтодермы. . Когда клетка решает стать эктодермой, она просто разрушает хромосомы 7-12.

Очевидно, эволюция такого рода пространственной организации довольно сложна. Многоклеточные организмы должны были изначально начать с этого метода дифференцировки. Однако, если это так, регулирование того, что делают клетки, становится намного проще, поскольку у клеток действительно нет выбора в этом вопросе. С другой стороны, вы всегда лечили рак!

Рассмотрим скромную бабочку. У него всего один геном, который он разделяет с еще более скромной гусеницей.

У бабочки шесть тощих ног, крылья, ооочень длинный скрученный хоботок, диета состоит из нектара... у гусеницы шестнадцать коренастых ног (шесть из них "настоящих", десять "ложноногих"), паутинные шипы, волоски, челюсти и диета из листьев... совершенно другое существо. Из тех же генов.

Две формы переключаются между активацией одной части генома и деактивацией другой. Таким образом, гены для создания и управления двумя совершенно разными существами могут работать из одного генома.

"скорее всего, изначально муха и паразит" - мне просто интересно, это фигура речи, или действительно было обнаружено, что разные участки ДНК бабочки напоминают таковые у мухи и "паразита"?
Это определенно НЕ паразит. У мух немного сложный жизненный цикл, как и у многих (большинства) насекомых. Но вполне вероятно, что существует оса-паразит, специализирующаяся на откладывании яиц именно в гусеницу этого вида.
Авр творог. Спасибо, @PeterMasiar - не знаю, откуда я это взял, мне показалось, что я читал это в New Scientist несколько лет назад, но сейчас не могу найти и следа. Наверное, я плохо помню, что читал какую-то сетевую чушь. Удалил, чтобы дальше не распространять чушь.
@Roux Вероятно, я неправильно запомнил - отредактировал, чтобы удалить это.

Это уже происходит. По крайней мере, что-то похожее на то, что вы имеете в виду.
У людей есть целый микробиом из множества разных организмов, живущих внутри нас и делающих для нас разные вещи. Удивительно небольшой процент клеток в вашем теле на самом деле является «вашей» ДНК. В частности, матери также передают много полезного «нечеловеческого» генетического материала своим потомкам.

Здесь есть много хороших ответов, но я хочу атаковать корень вопроса. Я думаю, что фундаментальная концепция ДНК ОП неверна. ДНК — это схема организма, содержащая инструкции о том, как конструировать и управлять каждой клеткой, из которой состоит этот организм. ДНК сама по себе не выполняет никакой биологической функции. Следовательно, организм может иметь только один набор ДНК. ПРИМЕЧАНИЕ: эта ДНК может немного отличаться от клетки к клетке из-за различных биологических процессов, таких как телеометрический распад, избирательное удержание и т. д., но ДНК остается той же, только потенциально недостающие части, которые содержались в исходной ДНК.

Я думаю, что ОП действительно ищет гиперсимбиоз до точки взаимной зависимости. Симбиоз — это когда разные организмы разделяют одно и то же физическое тело и распределяют разные биологические процессы, что приводит к большему процветанию тела (во всяком случае, это мое урезанное определение). Одним из возможных примеров этого является наша пищеварительная система, где мы полагаемся на множество различных организмов, которые расщепляют пищу, которую мы потребляем, на питательные вещества, способные усваиваться нашим реальным телом. Наше тело получает питание, в котором оно нуждается, а организмы получают безопасную среду обитания с более высоким потенциалом питания, в котором они нуждаются. Если бы вы убили все эти организмы, я уверен, что вы бы умерли.

Возвращаясь к предполагаемому уровню сложности OP, это возможно. Потребовалось бы, чтобы несколько организмов вступили в симбиотические отношения, а затем развили эти отношения. Это крайне маловероятно из-за того, сколько эволюционного сотрудничества потребовалось бы, но я верю, что при всей потенциальной жизни в нашей галактике, где-то какая-то группа организмов выиграла космическую лотерею.

Вполне разумно полагать, что такие системы существуют. Мгновенным примером может служить симбиоз грибов и водорослей, как описано в ответах выше.

Теоретически мы можем иметь эндосимбиоз в качестве примера, когда определенные клеточные органеллы имеют ДНК, отличную от клеточной.

И, судя по недавним технологическим достижениям, я не понимаю, почему невозможно применить то же самое в биоинженерии или смежных дисциплинах.

Добро пожаловать на сайт Часто. Не могли бы вы немного пояснить, почему вы считаете это разумным, подкрепив это своим собственным контентом. Мы стараемся не только отвечать да/нет, но и объяснять, почему, и поддерживать утверждения, сделанные в ответах. Если у вас есть вопросы, просто спросите.

Трудно сказать, поскольку мы секвенировали лишь небольшое количество видов по сравнению со всеми существующими. Но прямой ответ — попробовать это самостоятельно в области синтетической биологии. Задавайте дополнительные вопросы в группе Google DIYbio, если вы хотите узнать больше о том, как и с чего начать, и если вам больше нравится школа, хакерское пространство или домашняя лаборатория.

Вид с несколькими телами будет иметь одновременно несколько ДНК.

Военный корабль — это тип существа, который представляет собой не одно, а несколько существ, которые объединяются в один вид. Каждый из четырех видов имеет свою собственную ДНК. Усовершенствованной версией этого многотелого понятия является муравейник . Хотя у этого существа действительно есть несколько нитей ДНК, можно утверждать, что многотелое существо является даже самостоятельным существом.