Почему бы не использовать SDS-PAGE как метод обнаружения вирусов?

Недавно я занимался исследованием ДНК и знаю, что самый популярный метод обнаружения вирусов основан на ДНК. Узнав о белках, я удивляюсь, почему мы не выявляем вирусы на основе вирусных белков?

Если это окажется правдой, мы сможем сэкономить много денег, вместо проведения реакции ПЦР мы сможем обнаружить более одного заболевания в одной реакции.

Например, когда у меня есть последовательность вируса из генбанка NCBI, я могу знать, сколько белков производит организм-мишень, и рассчитать молекулярную массу каждого белка. Затем запустить его в геле SDS-PAGE, чтобы увидеть, как выглядят полосы, может быть, я смогу узнать, присутствует целевой организм или нет?

Например, ВИЧ производит 9 белков, и молекулярная масса каждого белка различна. Итак, после электрофореза у меня 9 полос. Основываясь на расстоянии между каждой полосой и молекулярной массе, можно узнать, присутствует ВИЧ или нет?

Ответы (1)

Проще говоря, ответ заключается в том, что вы можете попытаться обнаружить вирусные белки, но поскольку эти белки будут очень незначительными компонентами вашего образца, вам придется использовать метод иммуноблоттинга для обнаружения конкретного вирусного белка. Хотя иммуноблоттинг является довольно чувствительным методом, я считаю справедливым сказать, что он может быть технически сложным. Напротив, реакция ПЦР исключительно чувствительна и достаточно надежна. ПЦР также технически более прямолинейна, потому что с ДНК обычно легче работать, чем с белками.

До появления ПЦР методом выбора был иммуноблоттинг.

также многие вирусы будут иметь почти одинаковую молекулярную массу и, следовательно, почти идентичный образец SDS PAGE.
@AlanBoyd, комментарий удален.
Абсолютно правильно. И в пользу «более чем одного заболевания» это можно и обычно делается с помощью количественной ПЦР с гораздо более высокой чувствительностью, которую можно разумно получить с помощью вестерна или даже ELISA (который является жизнеспособной системой обнаружения, часто основанной на белке ) .