Например, самый большой известный на данный момент геном принадлежит дереву: http://motherboard.vice.com/read/the-largest-genome-ever-sequenced-belongs-to-a-tree
Я слышал, что потенциально это может быть связано с тем, что деревьям требуется много дубликатов определенных генов, потому что они всю жизнь живут под прямыми солнечными лучами.
Кто-нибудь знает какие-то конкретные научные гипотезы, почему это может быть так?
Это исследование недавно секвенированных видов сосны показало, что 82% генома повторяется . Это характерно для любого сложного генома, в том числе и человека. Такие последовательности часто считались « мусорной ДНК », хотя любой ученый скажет вам, что только потому, что мы не знаем их назначения, не означает, что у них их нет. Тем не менее, большая часть повторов связана с мобильными элементами , по сути, внутриклеточными паразитами, единственной целью которых является, по-видимому, самоусиление и чаще всего они вредны. Эти вкрапленные повторы составляют около 45% генома человека. В этой статье упоминается, что, исходя из гомологии последовательностей, примерно 65% генома сосны состоит из этих повторов (это 15 миллиардов пар оснований).
Интересно, что хотя геном сосны примерно в 7 раз больше, чем у человека, у него только вдвое больше предсказанных генов. Сосна имеет ~50 000 гипотетических генов, но только ~16 000 являются тем, что авторы называют высокой достоверностью. Когда геном человека был впервые секвенирован, в нем было около 35 000 гипотетических генов, но сейчас, примерно 10 с лишним лет спустя, предсказанных генов всего около 21 000. Кажется, слишком рано сравнивать их. Это также поднимает важный вопрос о том, что количество генов не обязательно связано со сложностью организма: червь C. elegans имеет около 20 000 генов.
Из бумаги:
Большой размер генома в первую очередь объясняется обширным вкладом вкрапленного повторяющегося содержимого (Morse et al. 2009; Kovach et al. 2010; Wegrzyn et al. 2013). Сборка генома ели европейской показала, что ретротранспозоны LTR, в частности, часто встраиваются в длинные интроны некоторых семейств генов (Nystedt et al. 2013). Кроме того, имеются данные о дупликации генов, псевдогенах и паралогах, хотя степень их неясна (Kovach et al. 2010; Pavy et al. 2012).
Я никогда не слышал о гипотезе, которую вы упоминаете (не то чтобы это что-то значило), но мне кажется, что еще рано говорить.
Дэйвид