Почему прокариотические промоторные последовательности записаны с 5' на 3', когда транскрипция идет с 3' на 5'?

Кажется, что промоторные области написаны в направлении от 5' к 3'. В моих заметках к лекциям, например, даны последовательности промоторных областей -35 и -10 следующим образом:

Регион промоутера

Википедия, похоже, согласна с их статьей о промоутерах .

Однако РНК-полимераза транскрибирует в направлении от 3' к 5', так как она считывает цепь матрицы в направлении от 3' к 5'. В таком случае, почему промоторные области не написаны также в направлении от 3' к 5'?

Это означает, что вместо последовательности -10 5'-TATAAT-3', почему она не 3'-ATATTA-5'соответствует направлению транскрипции?

Моя интуитивная догадка состоит в том, что о фактор распознает промоторную область в направлении от 5' к 3'. Но я не могу найти никакой информации, подтверждающей это предположение. Кроме того, если это правда, как это могло быть определено (экспериментально)? Более того, каким бы ни был ответ, применим ли он также к транскрипции у эукариот?

Ну давай же. Не может быть, чтобы в одном городе люди ехали налево, а в другом — направо. Достаточно плохо, когда мы, британцы, едем на континент. В этом нет никакой тайны, мы просто считываем все признаки генов на одной цепи.
@David Достаточно честно, я буду считать это следствием условности. Спасибо!

Ответы (1)

Последовательность ДНК по соглашению записывается, начиная с 5'-положения, поэтому предполагается направленность без явного написания 5' и 3'. Что касается того, почему это не последовательность нитей шаблона. Я бы сказал, что это также соглашение для простоты, потому что вам нужно написать только одну последовательность, если вы хотите обсудить гены и регуляторные элементы.

Почему прокариотические промоторные последовательности записаны с 5' на 3', когда транскрипция идет с 3' на 5'?
СпросиСетьПолитика конфиденциальности1y, 0v