Предложения для эксперимента? [закрыто]

Я был бы признателен за предложения для моего годичного проекта AP Biology. Такой проект будет состоять из стандартного эксперимента, проводимого в течение года, поэтому он должен быть достаточно существенным.

Меня интересует все, что связано с клеткой/ДНК/молебио с математической связью. Я бы предпочел нечто иное, чем простой статистический анализ, может быть, что-то вроде дифференциальных уравнений.

У меня есть доступ к стандартному лабораторному оборудованию бакалавриата; предположим, что я могу достать все необходимые материалы и провести эксперимент. Спасибо вам за помощь.

По предложению шигеты ниже я пролистал ссылки и нашел интересными генные схемы. Итак, что же такое генная цепь, как они моделируются и для чего используются?

системная биология.. проведите биологический эксперимент на клетке и разработайте математическую модель системы. вы можете проверить модель, используя эксперименты.
Вам действительно нужно сузить это. Мы не знаем ваших компетенций, материалов, которые у вас есть, полей различных лабораторий, к которым у вас может быть доступ, невозможно ответить на этот вопрос без гораздо более конкретной области.
Да, я, вероятно, должен был сказать об этом более конкретно; он будет отредактирован. Я займусь системной биологией.
Все еще нужно немного больше на стороне оборудования. Я считаю культуру тканей стандартной работой бакалавриата, потому что именно этим я занимался большую часть времени в бакалавриате. Я также играю в вестернах со средней школы. Вы упомянули клетки, у вас есть способ их культивирования, вы упомянули ДНК, у вас есть гелевые установки и средства для выделения ДНК, и молебио настолько широк, что на самом деле не ограничивает.
Да, у меня будет доступ ко всему, что вы упомянули.
Я до сих пор не уверен, что это хороший вопрос для SE, потому что я не уверен, что на него можно ответить, но я бы посмотрел на генетический эксперимент вперед. Вы можете делать прогнозное и аналитическое моделирование и легко продвигать генетику вперед в течение всего года.
Я предлагаю вам задать вопрос о цепи гена как отдельный вопрос. И вы также можете конкретизировать его — например, «как бы я построил эксперимент с такими-то требованиями / ресурсами, чтобы сделать то-то и то-то в отношении генных цепей».

Ответы (1)

Это немного сложно - большинство возможных ответов вам все равно не понравятся, но я дам вам три предложения.

Звучит так, будто вы хотите взять что-то с математической моделью и попытаться модулировать ее с помощью молекулярной биологии.

Кажется маловероятным, что я действительно могу дать вам конкретный проект, но есть четыре источника, на которые я рекомендую вам обратить внимание.

Я думаю, что я бы предложил дополнительные ограничивающие предположения:

  1. вы хотите работать с кишечной палочкой - это самый простой и доступный организм для работы.
  2. вы хотите работать с системой, которая содержится внутри одной плазмиды, поэтому она полагается только на 2 гена, чтобы действовать, 3 снаружи, или у вас будут проблемы с тем, чтобы заставить все это работать.
  3. вам нужна математическая система, которая уже имеет хорошо подогнанную модель, которую вы будете возмущать. создание новой модели может быть чем-то вроде большого первого проекта. (но кто я такой, чтобы указывать вам, что делать - это всего лишь предложения).

Первое предложение, которое у меня есть, это Джефф Хасти из UCSD . Он много внимания уделял колеблющимся генным цепям. У него есть простые системы, которые можно воспроизвести в небольшой лаборатории. Последняя работа, сочетающая осциллятор GFP с LUX, довольно крутая. И генераторы, и LUX независимо друг от друга являются хорошими системами для работы. . Я был судьей на научной выставке и могу сказать вам, что просто воспроизвести одну из его систем было бы внушительной работой.

Еще одна работа, на которую стоит обратить внимание, — это Адам Аркин . Он просмотрел множество кандидатов на компоненты схемы. Такие статьи, как «Охота за биологическим транзистором», могут натолкнуть вас на размышления. Это более широкий объем работы, и поэтому может потребоваться некоторое время, чтобы получить представление об этом.

В-третьих, если вам это скучно и вы хотите посмотреть шире, то можете полистать конкурсы iGEM . Это проекты с осцилляторами и системами биосинтеза, с которыми иногда связаны математические модели. Большим преимуществом здесь является то, что вы можете начать или присоединиться к команде iGEM, и тогда некоторые или все плазмиды уже будут сделаны - mol bio становится очень дорогим, если кто-то не подарит вам некоторые материалы.

Предложения для эксперимента? [закрыто]
СпросиСетьПолитика конфиденциальности1y, 0v