Я работаю в лаборатории, где у нас есть общий запас 30% акриламида, TEMED, TRIS-HCl (pH 6,8 и pH 8,8) и 10% (масса/объем) раствора SDS pH 7,2.
Мы используем рецепт для загрузки буфера (который мы, конечно, смешиваем с BME перед использованием):
Наша проблема в том, что нет разделения.
Я попытался сделать 2 геля, потому что я мог смешать разделяющий и укладочный гель, но я убедился, что не делаю этого во второй раз. Затем я попросил кого-то еще сделать гель, и у них это тоже не сработало (ничего на геле, ни образцов, ни лестницы).
Затем я переделал 10% раствор SDS и оба ТРИС-буфера, но опять происходит что-то странное, так как мы ничего не получаем на геле.
Гели, очевидно, полимеризуются, так как это твердый гель, когда вы достаете его для окрашивания и удаления красителей, и я не понимаю, как загрузочный буфер может это сделать, даже если вы его испортите (потому что вы должны увидеть что-то на геле, если ваш образец в лунке, даже без денатурации). Мы явно переделали загрузочный краситель и попробовали еще раз, но это не работает.
Я знаю, что в образцах есть белок, так как помещаю клеточный осадок и очищенный белок (каталитическую активность которого я проверил) на один и тот же гель.
У кого-нибудь есть рациональное объяснение этому или предположения о том, что обычно может быть неправильным.
Ниже приведено изображение геля, как он выглядит, когда он почти закончил работать при 200 В (80 мА) в течение примерно 40 минут. Когда мы окрашиваем и удаляем краску, на геле ничего не остается. Также я думаю, что цвет (бромфеноловый синий) выглядит немного странно на геле, не так, как обычно, см. рисунок ниже, но, возможно, я становлюсь немного параноиком.
После корректировки pH всего и создания нового рабочего буфера с новым раствором SDS разделение, кажется, вернулось.
Авишай Барной
РМ
канадец
ЛюбопытныйДерево