Мне нужно проанализировать два набора данных, состоящих из временных рядов измерений экспрессии генов. Один набор представляет собой данные in vivo из профилей экспрессии, полученные в период от нескольких дней до рождения до нескольких дней после родов. Второй набор данных был получен в клеточной линии C2C12, где t = 0 был определен как день, когда было достигнуто 100% слияние.
Существует ли оптимальный способ согласования двух временных рядов? Простое выравнивание двух серий с использованием двух выборок t = 0 в качестве отправной точки кажется произвольным.
Было бы трудно провести прямое сравнение течения между тканями и культивируемыми клетками. Вместо шкалы времени вы можете использовать маркеры. Например, Кислингер и др. показывают пик экспрессии SIX1 через 2 дня после дифференцировки; СМАД3, 4 дня. Я не тот человек, который может сказать, какие маркеры хороши, но я полагаю, что вы могли бы найти больше информации с помощью поиска литературы.
АлисаД
ддиез
Марко
мдперри