Эпистаз между хромосомами и индивидуумами, «гомозиготными по взаимодействиям»

Приносим свои извинения за любые ошибки в номенклатуре. Я математик, который делает набег на генетику для магистерской диссертации. В частности, я генерирую данные о генетической последовательности искусственных диплоидов и данные о фенотипе на основе известных эпистатических взаимодействий.

Основной вопрос

Я знаком с концепцией, согласно которой наличие нескольких копий одного аллеля (например, по одной от каждого родителя) может фактически увеличить экспрессию и тем самым изменить количественный фенотип (по крайней мере, в некоторых случаях?). Может ли это происходить и при эпистатических эффектах? Например, рассмотрим случай, когда геометрическое место 1 ( л 1 ) и локус 2 ( л 2 ) демонстрируют некоторое положительное взаимодействие ( β ) по признаку ( Д ).

Е [ Д ] знак равно мю + β ( л 1 л 2 )
Если обе хромосомы содержат рассматриваемый аллель в обоих локусах, то проявляет ли этот индивидуум большее увеличение признака, чем если бы у него была только одна хромосома с эпистатическими аллелями?

Второстепенный вопрос

Могут ли аллели эпистатически взаимодействовать, даже если они присутствуют в разных хромосомах? например, предположим, что аллель А в локусе 1 взаимодействует с аллелем В в локусе 2. У человека есть А в локусе 1 и b в локусе 2 на хромосоме 1. У него также есть а в локусе 1 и В в локусе 2 на хромосоме 2. Сделайте А и В из разных хромосом взаимодействуют? Моя интуиция - да, но я хочу проверки.

Большое спасибо!!!

Ответы (1)

Вопрос 1: Описываемые вами явления, при которых важно, имеете ли вы одну или две копии аллеля (например, фенотип АА отличается от фенотипа Аа), известны как эффекты доминирования . Эффекты доминирования могут взаимодействовать с эпистатическими эффектами (при которых фенотипический эффект одного локуса зависит от генотипа другого локуса).

Одним из хороших примеров является взаимодействие между локусом Agouti и локусом Mc1R у мыши oldfield ( Peromyscus polionotus ) при определении цвета шерсти. Гомозиготы темного цвета по локусу Agouti имеют темную шерсть независимо от аллеля в локусе Mc1R , тогда как цвет гетерозигот Agouti или гомозигот светлого цвета зависит от генотипа в локусе Mc1R . На приведенном ниже рисунке из Steiner et al (2007) показано:

Доминирование и эпистазные эффекты в окраске шерсти

Вопрос 2 : Эпистатически взаимодействующие локусы не обязательно должны находиться на одной и той же хромосоме. Обсуждаемые выше локусы представляют собой прекрасный пример. Mc1R находится на хромосоме 1, тогда как Agouti находится на хромосоме 7, но они взаимодействуют эпистатически.

Ах! Не могу поверить, что я совсем забыл, что существуют разные типы доминирования. В частности, в вопросе 1 это будет либо кодоминирование, либо промежуточное доминирование, верно?
Я не уверен, что понимаю, о чем вы спрашиваете. Если у нас есть аллели А и а, у нас может быть доминирование (Аа и АА имеют один и тот же фенотип), кодоминирование (Аа имеет фенотипы как аа, так и АА) или неполное доминирование (Аа имеет промежуточный фенотип между аа и АА).