Транскрибируется ли промоторная область гена?

Если РНК-полимераза присоединяется к промоторной области гена, будет ли она формировать начальный сегмент мРНК, читая промоторную область, или она будет скользить по ДНК, а затем читать соседнюю область? Или длина фермента настолько велика, что его определенная область присоединяется к промотору, в то время как соседняя область начинает считывать ДНК с образованием мРНК?

Читает ли РНК-полимераза пары оснований ДНК и добавляет ли комплементарные пары оснований РНК одну за другой? Или он считывает группы пар оснований так же, как тРНК, которая считывает триплеты оснований?

Транскрибируется ли терминаторная область также до окончания процесса транскрипции или же транскрипция заканчивается сразу после того, как РНК-полимераза достигает терминаторной области? Если имеет место последнее, то как транскрипция заканчивается только тем, что полимераза считывает терминаторную область?

Итак, следует ли считать промоторную и терминаторную области гена частями гена или отдельными объектами?

В геномных аннотациях считается, что гены начинаются с первого основания, найденного в секвенированном транскрипте, и заканчиваются последним основанием секвенированного транскрипта.
Слишком много вопросов, слишком мало усилий.

Ответы (1)

будет ли он формировать начальную часть мРНК вскоре после прикрепления, считывая промоторную область?

РНК-полимераза связывается с промотором, однако, поскольку она настолько велика, ее передний конец свисает с конца промотора. Когда начинается транскрипция, промотор не включается, так как процесс транскрипции происходит перед полимеразой.

регион промоутера

Кроме того, считывает ли РНК-полимераза пары оснований ДНК одну за другой и добавляет ли пары оснований РНК к цепи одну за другой?

РНК-полимераза добавляет нуклеозидтрифосфат (НТФ) один за другим. Как показано на рисунке ниже, в активном центре есть место только для одного NTP, и после размещения правильного NTP он добавляется в цепочку РНК.

РНК-полимераза II

Как процесс завершается простым чтением области терминатора?

Вопрос об окончании зависит от ячейки. Прокариоты оканчиваются либо Rho-независимым, либо зависимым отростком. Независимо в РНК возникает шпилька, обрывающая транскрипт, зависимо связывается Rho-фактор, вызывающий терминацию. Эукариоты менее известны, но обычно считается, что после сайта поли-А есть также факторы, которые связываются и индуцируют терминацию.

Итак, следует ли считать промоторную и терминаторную области гена частями гена или отдельными объектами?

Этот вопрос немного больше об определениях, чем биология. Оксфордский словарь английского языка определяет ген как «основную единицу наследственности в живых организмах». Поскольку промоторная, некодирующая и нетранслирующая области по-прежнему имеют первостепенное значение для производства белка, я бы сказал, что они по-прежнему являются частью гена и более крупной наследственной единицей.