Я хотел бы знать, в чем разница между цис-регулирующими элементами и гиперчувствительными к ДНКазе I участками, чтобы произвести значимое разделение некодирующих элементов, влияющих на экспрессию генов.
Цис -регуляторные элементы — это просто участки ДНК выше или ниже гена, которые могут влиять на его экспрессию (в основном они должны находиться в одной и той же хромосоме).
Сверхчувствительные к ДНКазе-I сайты (DHS) представляют собой области хроматина, которые перевариваются во время обработки ДНКазой, потому что они открыты, т.е. не защищены белком (комплексом). Белковый комплекс может быть либо нуклеосомой, либо фактором транскрипции. Следует отметить, что участок ДНК может быть нечувствительным к ДНКазе также из-за своей конформации.
Обычно цис -регуляторные элементы проявляют свои эффекты, выступая в качестве сайта связывания факторов транскрипции (или ремоделеров хроматина). Если белки связываются в этих местах, то эти области будут защищены от расщепления ДНКазой, что сделает их не -DHS. Однако известно, что элементы ДНК могут действовать и в транс (см. статьи о захвате конформации 3С-хромосомы и его вариантах). Более того, защищен сайт от ДНКазы или нет, ничего не говорит о его функции.
еще один "хомо сапиен"