Сплайсированы ли некоторые некодирующие РНК?

Вы должны проверить Howald C et al ^[1] . Это одна из многих недавних статей, связанных с данными ENCODE . Они использовали RT-PCR для амплификации соединений экзон-экзон, а затем секвенировали результаты. В дополнительной таблице 2 показано 3076 подтвержденных экзон-экзонных соединений в предполагаемых обработанных транскриптах, которые в основной части статьи могут быть подразделены на следующие подклассы:

Некодирующие, 3prime_overlapping_ncrna, Ambiguous_orf, Antisense, LincRNA, ncRNA_host, Retained_intron, Sense_intronic, Sense_overlapping, Обработанный транскрипт.

1. Howald C, Tanzer A, Chrast J, Kokocinski F, Derrien T, Walters N, Gonzalez JM, Frankish A, Aken BL, Hourlier T, Vogel JH, White S, Searle S, Harrow J, Hubbard TJ, Guigó R, Reymond A . 2012. Объединение RT-PCR-seq и RNA-seq для каталогизации всех генных элементов, закодированных в геноме человека. Genome Research, 22: 1698–1710, doi:10.1101/gr.134478.111 .

Вы называете рибосомную РНК некодирующей? рРНК сплайсируется как у прокариот, так и у эукариот.

Да, обратите внимание на HOTAIR (у человека), а также на cyrano и megamind у рыбок данио — они все сращены.