Вопрос о филогениях и секвенировании ДНК

Я читаю эту веб-страницу, на которой рассказывается о филогениях и секвенировании ДНК:

https://bioinf.comav.upv.es/courses/biotech3/theory/phylogeny.html

В одном предложении говорится: «Если мы сочтем дельфинов и акул близкородственными, потому что они имеют схожую форму, мы ошибемся».

Если бы мы взяли последовательность ДНК дельфинов и акул и сравнили бы гены, кодирующие форму, разве они не были бы очень похожи? Не могли бы мы тогда заключить, что дельфины и акулы похожи?

Или в качестве обходного пути мы изучим весь геном, то есть всю последовательность ДНК, чтобы увидеть, единственное ли у них сходство?

Ответы (2)

Гены отражают собственную филогению. Так что нет, гены «формы» (если бы они существовали) были бы очень разными у дельфинов и акул. Каждый отдельный ген дельфина больше похож на свой гомологичный аналог коровы, чем на любой ген акулы. Ген за геном или с целым геномом, это не имело бы значения. Сходство между акулами и дельфинами связано с конвергенцией. Конвергенция имеет смысл в том, что существует избирательное давление, чтобы иметь обтекаемые тела, чтобы плыть по воде. Гены тоже могут конвергировать, но нуклеотиды будут разными, как различаются плавники у акул и дельфинов.

На самом деле не существует «генов, кодирующих форму». Если вы посмотрите на гены, кодирующие важные метаболические пути, станет ясно, что дельфины — млекопитающие, а акулы — нет.

Да я вижу. Но, например, если мы возьмем действительно родственные организмы, скажем, сумчатых волков и плацентарных волков, которые представляют собой два совершенно разных вида, не связанных между собой. Разве мы не могли бы ошибочно заключить, что они чрезвычайно близки, даже если бы мы секвенировали их геномы? Например, мы увидим, что у них, возможно, похожие зубы, шерсть и т. д.
Если бы вы посмотрели на все кодирующие гены и образцы синтении, вы бы увидели, что сумчатые волки и плацентарные волки выглядят так, как будто они принадлежат к разным подклассам. Внешнее сходство маскирует различия, присутствующие на уровне ДНК.
Нет неродственных организмов. Волки родственны папоротникам, которые родственны бактериям, потому что жизнь монофилетична. Сумчатые волки и плацентарные волки похожи из-за конвергенции эффективного фенотипа. Однако каждый ген сумчатого волка ближе к генам коалы, чем к плацентарному волку.