Регуляция структуры хроматина

Недавно я рассмотрел различные уровни структуры хроматина. Первичный уровень — нуклеосомы, где ДНК связана с гистонами и имеет структурное сходство с «бусами на нитке». Вторичный уровень представляет собой волокно 30 нм, а третичный уровень формируется путем радиального скручивания волокон.

Я также узнал о гистоновом коде и о том, как различные модификации основных гистонов связаны с регуляцией транскрипции. Являются ли эти модификации первичным механизмом регуляции структуры хроматина? Другими словами, принимает ли хроматин наиболее компактную возможную структуру до тех пор, пока не будут сделаны модификации гистонов, чтобы сделать возможной транскрипцию? Или были обнаружены и охарактеризованы другие регуляторные механизмы, не связанные с транскрипцией?

Хроматин AFAIK не приобрел бы наиболее компактную структуру без активности топоизомеразы.

Ответы (1)

«Являются ли эти модификации первичным механизмом регуляции структуры хроматина?»

Это зависит от того, как вы определяете первичность, в настоящее время мы можем считать модификации гистонов первичными, потому что другие регуляторные механизмы еще недостаточно изучены. Еще вы можете подумать о различных регуляторных белках, которые взаимодействуют с гистоновыми метками для модификации хроматина.

Я не думаю, что вы должны представлять себе хроматин как предполагающий «наиболее компактную структуру, возможную до тех пор, пока не будут сделаны модификации гистонов, чтобы обеспечить транскрипцию», а скорее модификации гистонов представляют собой динамический процесс с различными факторами транскрипции (класс белков), которые входят и добавляются/удаляются гистоновые метки, а также «ремоделирование хроматина» (добавление/удаление нуклеосом)

В качестве примечания: я не думаю, что много известно о третичной стадии, которую вы изначально упомянули, поэтому, возможно, она может играть огромную роль в механизмах регуляции структуры хроматина, просто она недостаточно изучена.