Я пытаюсь представить себе жизненный цикл белка (рассматриваемого как конкретная молекула).
Вот как я могу себе это представить:
После того, как клетка рождается, белковая молекула впервые синтезируется путем экспрессии генов de novo . Это происходит в определенный момент времени и в пространстве, обычно на рибосоме, которая может располагаться в любом месте внутри клетки.
От места своего образования (комбинация или рекомбинация, см. ниже) белок перемещается к своему конечному пункту назначения, например, как ионный канал в клеточной мембране. (Но, возможно, он уже был синтезирован очень близко к месту использования.) Или он просто плавает в цитозоле . (Возможно, он собирает вокруг себя какие-то другие биомолекулы.)
Вне зависимости от того, прибыл он или нет: белок живет и работает какое-то время.
В конце концов, он повреждается (= теряет небольшие функциональные единицы), но восстанавливается на месте . Продолжайте с 3.
В конце концов, он помечается убиквитином и разрушается контролируемым образом. Продолжайте с 7.
В конце концов, он самопроизвольно распадается (= распадается на более крупные фрагменты).
Его фрагменты высвобождаются (в случае, если он был связан) и снова начинают плавать в цитозоле.
В конце концов его (или других белков) фрагменты рекомбинируются (в определенные моменты времени и пространства, возможно, на «рефабриках», сравнимых с рибосомными «фабриками»). Продолжайте с 2.
Верна ли эта приблизительная картина жизненного цикла белка?
Если да: что известно о временных диапазонах, в которых происходят эти процессы? Особенно: как долго длится эффективная жизнь и время работы типичных белков? Существуют ли белки, которые живут и работают всего несколько минут или часов, а есть другие, которые живут месяцами или годами? (Конкретные примеры приветствуются!)
Период полураспада белков варьируется от менее 30 минут (например, оксидоредуктазы) до более 200 часов (например, некоторые белки, связывающие нуклеиновые кислоты) и по крайней мере до 2000 часов [Rahman & Sadygov, 2017, PLoS One 12( 7): e0180428].
Больше сайтов убиквитинирования, короче период полураспада; больше/больше внутренне неупорядоченных областей, более короткий период полураспада; более тесная связь с клеточным циклом, более короткий период полувыведения.
Примечание. Не все эукариотические белки расщепляются убиквитин-протеасомным протеолитическим путем.
http://journals.plos.org/plosone/article?id=10.1371/journal.pone.0180428
Жиллен
Ханс-Петер Стрикер
еще один "хомо сапиен"
Ханс-Петер Стрикер