Что такое структурная РНК?

В генбанке ( ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/genomes/archive/old_refseq/Fungi/Saccharomyces_cerevisiae_uid128/ ) есть архив .frn (нуклеотидные последовательности структурных РНК в формате fasta), и я хочу знать различия между структурными РНК и генами. Являются ли нуклеотидные последовательности структурных РНК кодирующей областью?

Моя цель — отделить кодирующую область от некодирующей области данного полного генома.

Я физик, поэтому прошу прощения, если мой вопрос довольно прост.

@ Дэвид Я думаю, что «структурная РНК» не является стандартным термином. Я даже не жду, что биологи будут уверены в том, что это может означать.
@WYSIWYG — проверка одного файла с расширением .fm дает имена для некоторых из этих структурных РНК, таких как Pro тРНК, 15S рибосомная РНК. Я предполагаю, что плакат прочитал это. Я ожидал, что он попытается выяснить, что такое тРНК и рибосомная РНК. Если он не готов приложить усилия к чтению о молекулярной биологии, он зря тратит свое (и наше) время.

Ответы (1)

Если быть очень кратким: ген — это последовательность ДНК или РНК, которая передается по наследству и выполняет биологическую функцию. В опубликованном вами геноме Saccharomyces cerevisiae каждый ген представляет собой последовательность ДНК. Функция большинства генов заключается в том, чтобы транскрибироваться в информационную РНК (мРНК), которая затем транслируется в белок. «Кодирующая» ДНК относится к ДНК, последовательность которой в конечном итоге транслируется в белок.

Структурные РНК кодируются генами, но не транслируются в белок и, таким образом, не являются кодирующими областями. Они состоят из РНК, но функционируют скорее как белки. Когда они запускают реакции, такие как ферменты, их называют рибозимами . Наиболее известными из них являются рибосомы , которые являются неотъемлемой частью биосинтеза белка. Другие образуют специальные структуры, которые помогают молекулам узнавать друг друга. тРНК необходимы рибосоме для распознавания нужных аминокислот.

Как сказал Дэвид, это очень простая молекулярная биология, и регуляция/экспрессия генов у эукариот может быть довольно сложной . Статьи в Википедии представляют собой хорошее введение, а книга Берга по биохимии, на которую он ссылается, является отличным дальнейшим чтением. Если вы хотите узнать больше о геномах дрожжей, вы можете посетить https://www.yeastgenome.org/ . Он предоставляет много информации о количестве кодирующих/некодирующих областей и их функциях. Существует также графический браузер генома, где вы можете подробно просмотреть каждый регион и сравнить его с вашими собственными находками.

Кодирующая ДНК относится конкретно к областям, которые транслируются в белок. Некодирующие РНК, такие как тРНК или рРНК, по определению не являются частью кодирующих областей.
я одобрил редактирование, но я не уверен, что можно изменить ключевую концепцию ответа другого пользователя.
Терминология молекулярной биологии, как правило, сложна, и иногда ее использование варьируется от человека к человеку.