В генбанке ( ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/genomes/archive/old_refseq/Fungi/Saccharomyces_cerevisiae_uid128/ ) есть архив .frn (нуклеотидные последовательности структурных РНК в формате fasta), и я хочу знать различия между структурными РНК и генами. Являются ли нуклеотидные последовательности структурных РНК кодирующей областью?
Моя цель — отделить кодирующую область от некодирующей области данного полного генома.
Я физик, поэтому прошу прощения, если мой вопрос довольно прост.
Если быть очень кратким: ген — это последовательность ДНК или РНК, которая передается по наследству и выполняет биологическую функцию. В опубликованном вами геноме Saccharomyces cerevisiae каждый ген представляет собой последовательность ДНК. Функция большинства генов заключается в том, чтобы транскрибироваться в информационную РНК (мРНК), которая затем транслируется в белок. «Кодирующая» ДНК относится к ДНК, последовательность которой в конечном итоге транслируется в белок.
Структурные РНК кодируются генами, но не транслируются в белок и, таким образом, не являются кодирующими областями. Они состоят из РНК, но функционируют скорее как белки. Когда они запускают реакции, такие как ферменты, их называют рибозимами . Наиболее известными из них являются рибосомы , которые являются неотъемлемой частью биосинтеза белка. Другие образуют специальные структуры, которые помогают молекулам узнавать друг друга. тРНК необходимы рибосоме для распознавания нужных аминокислот.
Как сказал Дэвид, это очень простая молекулярная биология, и регуляция/экспрессия генов у эукариот может быть довольно сложной . Статьи в Википедии представляют собой хорошее введение, а книга Берга по биохимии, на которую он ссылается, является отличным дальнейшим чтением. Если вы хотите узнать больше о геномах дрожжей, вы можете посетить https://www.yeastgenome.org/ . Он предоставляет много информации о количестве кодирующих/некодирующих областей и их функциях. Существует также графический браузер генома, где вы можете подробно просмотреть каждый регион и сравнить его с вашими собственными находками.
WYSIWYG
Дэйвид