Я студент бакалавриата компьютерной инженерии, и у меня есть проект по биоинформатике. Таким образом, мне нужно найти предсказание (или ассоциацию, я не уверен в правильной терминологии) достоверности взаимосвязей заболеваний микроРНК. Поясню мой вопрос на примере. Например, в одной из баз данных, связанных с биоинформатикой (HMDD), говорится, что микроРНК X связана с болезнью Y. Я хочу выяснить, в чем заключается уверенность. Я имею в виду, что вы на 100% уверены в таких отношениях? Знаете ли вы какую-либо базу данных для этой цели? В HMDD я могу найти только пары miRNA - названия болезни, это не дает никакой статистики.
Вы можете начать с изучения того, как микроРНК регулирует функционирование гена. он в основном связывается с 3'UTR и 5'UTR мРНК и ограничивает ее трансляцию. Будут гены, связанные с интересующим вас заболеванием, найдите микроРНК, связанные с этими генами. Вы можете использовать данные микромассивов, чтобы узнать, какие гены активируются. Целевое сканирование человека, miRDB, представляет собой различные базы данных для поиска микроРНК, связанных с генами. Уровень достоверности для обнаружения ассоциации определенных микроРНК с заболеванием никогда не может быть 100%. но взаимосвязь может быть установлена простым просмотром комплементарности между микроРНК и мРНК, экспрессируемой во время болезненного состояния.
Нандор Пока
StackUnderflow
WYSIWYG