Что такое выборочное ограничение?

Я столкнулся с термином селективное ограничение у Huber et al. 2015 г. , стр. 4 (последний абзац) в:

Если в анализ включены неизменяемые сайты, то оба метода Kim и Stephan (2002) и Nielsen et al. (2005) могут быть чувствительны к предположениям относительно селективного ограничения и частоты мутаций.

но контекст не совсем помогает.

Что это за определение выборочного ограничения?

Связано ли это с летальными мутациями в некодирующих областях? Связано ли это с вмешательством в отбор?...

Пожалуйста, используйте среду кавычек вместо среды кода (насколько я знаю, большинство программ чтения с экрана начнут читать это посимвольно).

Ответы (1)

Именно давление отбора определяет и ограничивает количество нейтральных/полезных мутаций, которые могут иметь место. Чем более ограниченный локус подвергается отбору, тем легче генерировать вредные мутации и тем труднее генерировать полезные; это может отражаться в низких скоростях замещения в таких локусах в популяциях с течением времени.

Одним из широко используемых методов измерения этого является вычисление отношения Ka/Ks, чтобы сделать вывод о том, ограничен ли локус выборочно или нет.

+1 Спасибо. Можем ли мы связать значение с этим понятием? Например, выборочное ограничение может быть С "=" К а / К а или С "=" м ты б / м ты д , где м ты б и м ты д - частота полезных и вредных мутаций соответственно.
Легче измерить Ka и Ks, поэтому, если что-то не подвергается отбору (нейтральное), вы увидите отношение 1, меньше 1 указывает на очищающий отбор, больше 1 указывает на положительный отбор. Подробнее здесь cs.mun.ca/~banzhaf/papers/ppsn08_evorate.pdf