Это ссылка на обзор анализа мозаики C. elegans, проведенный Yochem и Herman , в котором авторы проводят различие между свободными фрагментами хромосом и внехромосомными массивами.
Для первого они ссылаются на Herman 1984 . Что касается последнего, они ссылаются на Lackner et al 1994 и Miller et al 1996 , но это исследования, в которых используются внехромосомные массивы, а не статьи, определяющие их как технику как таковую.
Мне любопытно узнать, в чем разница - у меня сложилось впечатление, что внехромосомные массивы представляют собой фрагменты с множеством копий интересующего гена + маркер.
Я спросил своего профессора, и ответ, похоже, заключается в различиях как в поколении, так и в конечном продукте.
Свободные фрагменты хромосом образуются в результате облучения/другого повреждения зародышевой линии у одного животного. Путем серии скрещиваний можно ввести отдельные фрагменты (содержащие дупликацию интересующего вас гена, а также маркер) в мутантный фон. Внехромосомный фрагмент будет потерян во время митоза на различных этапах развития, и при мозаичном анализе вы можете найти потерю своего маркера (и, следовательно, потерю аллеля дикого типа) и посмотреть, требуется ли продукт yfg в определенной клетке. типы для фенотипа дикого типа.
Внехромосомные массивы создаются путем клонирования, и у вас обычно есть много копий как гена, так и маркера. Это тот же принцип, что и свободные хромосомные фрагменты с точки зрения мозаичного анализа, но он очень мощный, так как вы можете легко клонировать отдельные гены (в отличие от облучения и надежды обнаружить yfg на фрагменте) и маркеры (и теперь вы можете использовать неэндогенные маркеры). как ГФП).
Несмотря на то, что внехромосомные массивы создать сравнительно легко, проблема заключается в том, что в конечном итоге вы получаете множество копий гена, что приводит к неэндогенным уровням дозировки. Даже если это не вызывает совершенно другого мутантного фенотипа в клетках, вполне возможно, что достаточное количество этих белков может сегрегировать при митозе в дочерние клетки, так что даже если фрагмент будет потерян, вы все еще можете иметь свой генный продукт. в дочерних клетках (если ваш маркерный белок также не разделялся подобным образом, вы могли бы сделать ошибочные выводы о необходимости продукта YFG в этих конкретных клетках).
бэп