Имеют ли фаговые репрессоры CI и Mnt перекрестные помехи?

Я заинтересован в использовании белков CI и Mnt, а также их соответствующих промоторов (pR и Pmnt) в одной и той же синтетической системе, но меня беспокоит их сходство и потенциальные перекрестные помехи. Быстрый поиск в литературе не дал результатов, и Multalin действительно показал некоторую значительную гомологию последовательностей (хотя Mnt образует гомодимер, а CI - нет).

CI и Mnt Multalin

pR и Pmnt Мульталин

Последовательности: CI и pR , репрессор Mnt и промотор Mnt

Сообщалось ли когда-нибудь, что репрессор CI или Mnt проявляет перекрестные помехи на промоторах pR и Pmnt?

Ответы (1)

Отчетов по нему пока нет. Я не думаю, что только потому, что они показывают общую гомологию, они будут демонстрировать перекрестные помехи. Просто посмотрите выравнивание ДНК-связывающих доменов этих белков первых ~70 остатков от N-конца. Более того, их DBD принадлежат к разным семействам PFAM.

Аналогично с промоторными последовательностями. Как сообщается на сайте iGEM:

  • Промоутер MNT:tagatctcctatagtgagtcgtattaattt

  • cI промоутер:gtgttgactattttacctctggcggtgata

Они совсем другие. Более того, если бы iGEM имел заявленную стандартную часть, такую ​​как бистабильный системный компонент: промотор Mnt/cI ( BBa_K228003 ), то он был бы в значительной степени стандартизирован. Детали iGEM обычно надежны.

Имеют ли фаговые репрессоры CI и Mnt перекрестные помехи?
СпросиСетьПолитика конфиденциальности1y, 0v