Я знаю об энхансерах и механизме, который приводит их к увеличению экспрессии генов их целей, но мне интересно, существуют ли подобные репрессоры ДНК. Я знаю о белковых репрессорах, но я ищу в геноме какой-нибудь эквивалент анти- (или обратного) энхансера, который действовал бы как энхансер, но снижал экспрессию генов.
Я знаю о репрессированных/уравновешенных энхансерах, которые могли бы быть таким процессом, даже если на самом деле это не чистая репрессия гена-мишени, а скорее «не-сверхэкспрессия». Я также знаю об изоляторах, но опять же это будет другой механизм.
Возможно, какие-то репрессоры белка, связывающего межгенную область, которые по механизму укладки, сходному с энхансерами, репрессируют ген?
Да, эти последовательности существуют и называются они " глушителями " (удивительно, правда?). Существуют различные механизмы, с помощью которых может происходить это замалчивание генов.
В «классическом» способе сайленсер связывается с фактором транскрипции, который либо пассивно подавляет ген, препятствуя связыванию специфических факторов транскрипции, либо активно предотвращая сборку общих факторов транскрипции. См. рисунок из статьи 1:
Кроме того, существуют неклассические негативные регуляторные элементы (NRE), которые обычно представляют собой элементы выше промотора, которые ингибируют связывание регуляторных белков. NRE также могут быть энхансерами в зависимости от связанных с ними белков. Некоторые NRE могут индуцировать изгиб ДНК, препятствуя доступу к энхансерам или промоторным элементам.
Использованная литература:
Нандор Пока
Кальяри2005
Нандор Пока