«Энхансеры» энхансеров?

Я ищу примеры (если есть) участков генома, которые регулируют активность энхансеров, увеличивая или уменьшая ее. По сути, это какие-то энхансеры (или репрессоры) энхансеров, чтобы провести аналогию с русской куклой. Я знаю об эпигенетических маркировках, но на самом деле я рассматриваю пример области ДНК, непосредственно действующей на энхансер, аналогично тому, как энхансер действует непосредственно на промотор.

Я спрашиваю об этом, потому что я не мог найти никаких примеров и задавался вопросом, пропустил ли я такой отчет/статью.

Вас не волнует, если это из вирусного генома?
@AtlLED Если это ДНК-вирус, то это работает. Меня интересуют вторичные и третичные структуры ДНК.
Вполне возможно, что некоторые энхансерные области могут связывать регуляторные белки с более высокой аффинностью, чем другие энхансерные области, тем самым подавляя степень активации генов, регулируемых «участком энхансера с более низкой аффинностью».
@Wolgast Интересная идея. Это своего рода генная регуляция через конкуренцию. Я не знаю, происходит ли это на самом деле в клетке (т.е. находятся ли некоторые ТФ в диапазонах концентраций, вызывающих такой эффект), но в любом случае стоит разобраться в этом. Спасибо.
Да, в самом деле. Мне интересно, куда это вас приведет. Дайте мне знать, если вы найдете что-нибудь! :-)
@Wolgast Обязательно сделаю!

Ответы (1)

Если вы ищете строго и непосредственно опосредованный эффект ДНК-ДНК (без гистонов, без участия транскрипции), я бы искал эффекты последовательности на ремоделирование хроматина, модулируя доступ факторов транскрипции (TF) к их элементам. Кое-что об этом может быть в этой статье: Szerlong, HJ, & Hansen, JC (2011) . Распределение нуклеосом и линкерная ДНК: связь ядерной функции с динамической структурой хроматина. Биохимия и клеточная биология = Biochimie et Biologie Cellulaire, 89 (1), 24–34. дои: 10.1139/O10-139

«Энхансеры» энхансеров?
СпросиСетьПолитика конфиденциальности1y, 0v