Избыточность генетического кода

Колебание в паре — это просто явление, а не жесткое правило. Есть некоторые обоснования того, почему она должна существовать, и именно поэтому она до сих пор называется гипотезой. И это утверждение неверно: « основание на третьем положении кодона и основание на антикодоне не обязательно должны быть комплементарными ». Остаток антикодона, соответствующий третьему остатку кодона, может представлять собой неразборчивое основание, которое может образовывать пары с двумя или многими различными основаниями. тРНК фенилаланина имеет антикодон, GAAкоторый может сочетаться как с , UUUтак и с , UUCно не с UUA.

Таким образом, формулировка гипотезы колебания состоит в том, что первое основание антикодона (часто представляет собой модифицированное/атипичное нуклеотидное основание) может демонстрировать неразборчивость связывания.

Вы правы, говоря, что Крик в своей гипотезе колебания предположил, что «основание на третьем положении кодона и на антикодоне не обязательно должны быть комплементарными», но « не обязательно» в вашем утверждении является парафразом « некоторые » в исходном заявлении Крика:

 «Предполагается, что, хотя стандартные пары оснований могут использоваться довольно строго в первых двух позициях триплета, в спаривании третьего основания могут быть некоторые колебания».

Если вы прочитаете эту статью или обратитесь к статье Википедии в разделе Wobble , вы поймете, что Крик использует слово «некоторые», чтобы указать, что:

(i) Предлагаемое колебание характерно для определенных пар оснований.

(ii) Такие пары оснований колебания будут обнаружены только в тех случаях, когда они не нарушают генетический код.

Гипотеза Колебания , как указано выше, однозначно подтвердилась. Конкретные правила колебания , которые Крик предложил для удовлетворения пункта (i), были основаны на изучении химии оснований и оказались частично правильными:

Правила колебания: предсказания происхождения Крика по сравнению с наблюдаемыми основаниями 5'-антикодонов и их спариванием оснований с кодонами.

Таким образом, предсказание о том, что антикодоновые основания 5'-тРНК G и I могут колебаться (а C не может), подтвердилось. Крик знал о недостатке А в этом положении в антикодонах, и как он, так и U обычно обнаруживаются в химически модифицированных формах, спаривание оснований которых он не пытался предсказать (он не знал о большинстве из них) и которые отличается в разных случаях. Следует помнить, что для этого есть научное обоснование с точки зрения трехмерной структуры антикодона в тРНК (которая удерживает первые два основания на месте за счет укладки оснований) и близости групп, потенциально образующих водородные связи. в различных базах.

Пункт (ii) состоит в том, что Природа будет использовать Колебание только там, где позволяет генетический код . Соединение G с C или U всегда работает, тогда как спаривание I с A, C или G будет работать с аминокислотами, кодируемыми всеми четырьмя основаниями в блоке (например, Leu, Val, Ser), но не там, где есть блоки из двух (например, Тюр, Его, Асн).

И последний момент, который подчеркивает химическую основу всего этого. Митохондрии млекопитающих имеют другой набор правил колебания из-за их своеобразно укороченных тРНК.