Как прочитать паттерн экспрессии РНК?

При чтении о болезнях можно найти ссылки на белки и связанные с ними гены, пример которых здесь .

Мне интересно, как неспециалисту в этой области расшифровать/прочитать следующий график:

Паттерн экспрессии РНК

Что все это значит?

Это не особый график, поэтому, как и любой другой график, вам (и нам) необходимо знать, что такое оси, что означает цветовая кодировка и что означает 203411_s_at (т. е. информация о заголовке). Есть ли легенда о фигуре? Если да, укажите это в своем вопросе. Я мог бы объяснить, о чем я думаю, но сначала вам нужно приложить некоторые усилия к себе.

Ответы (1)

На этом изображении показана экспрессия гена (в вашем случае Lamin A/C) в различных тканях. Картинка с более высоким результатом для мыши выглядит так (отсюда ) :введите описание изображения здесь

Вы можете увидеть медиану экспрессии (рассчитанную по всем образцам), а также увидеть, в каких тканях этот ген сильно экспрессирован, а в каких меньше или совсем нет.

Это важно, если вы хотите проанализировать функцию гена. Тканеспецифический паттерн экспрессии может сильно различаться в разных тканях (как вы можете видеть на рисунке), что может дать информацию о функции гена. То же самое верно, если вы посмотрите на распределение экспрессии генов во времени, вы сможете определить гены, которые важны для разных стадий дифференцировки.

Это имеет большой смысл. Чтобы убедиться, что я понимаю, показывает ли приведенный выше график, что легочная ткань экспрессирует этот конкретный ген больше (в среднем), чем все другие ткани? Что означают цифры?
@UltimateHawk Да, именно так. Я не уверен насчет числа на данный момент, но я думаю, что они относительно некоторой нормализации.
Как прочитать паттерн экспрессии РНК?
СпросиСетьПолитика конфиденциальности1y, 0v