Различаются ли гены домашнего хозяйства в разных тканях

Я работаю над проектом RNA-Seq и знаю, что некоторые исследователи используют гены домашнего хозяйства в качестве метода нормализации. В моем проекте есть несколько разных тканей, и мне было интересно, инвариантна ли экспрессия гена домашнего хозяйства в целом для разных типов тканей?

Универсального гена домашнего хозяйства не существует.

Ответы (2)

Мой опыт таков: да, они могут сильно различаться (в соответствии с различиями в генетическом профиле клеток), и вы должны проверить это. В качестве основы могу порекомендовать прочитать статьи, перечисленные ниже. Они в основном изучают это в контексте ПЦР в реальном времени, но это должно быть справедливо и для РНКсек. Для некоторых приложений также рекомендуется использовать более одного гена для нормализации.

Использованная литература:

  1. Точная нормализация количественных данных ОТ-ПЦР в реальном времени путем геометрического усреднения нескольких генов внутреннего контроля.
  2. Отбор генов домашнего хозяйства для изучения экспрессии генов в ретикулоцитах человека с использованием ПЦР в реальном времени
  3. Референтные гены / гены домашнего хозяйства
  4. Отбор генов домашнего хозяйства на основе онтологии генов для нормализации секвенирования РНК

Это зависит от определения генов домашнего хозяйства. Компания ENCODE недавно выпустила секвенирование РНК 17 тканей на 8 стадиях развития .

Также был предоставлен список генов домашнего хозяйства .

Они не совсем постоянны. Просто они менее изменчивы, чем другие гены.

введите описание изображения здесь

Ваш ответ звучит так, как будто он может быть правильным, однако для того, чтобы читатель узнал, ему нужно перейти на внешний сайт. Было бы полезнее и больше соответствовало бы нашей модели, если бы вы могли конкретизировать свое утверждение «Они не совсем постоянны» с некоторыми репрезентативными примерами, которые позволили бы нам проголосовать за ваш ответ. Заинтересованный читатель (автор, вероятно, уже закончил свой проект) может перейти по вашей ссылке для получения полной информации.
Различаются ли гены домашнего хозяйства в разных тканях
СпросиСетьПолитика конфиденциальности1y, 0v