В геноме человека много некодирующих участков, в том числе регуляторные элементы, повторяющаяся ДНК и интроны. Предположим, что в хромосоме есть два соседних гена, и их положение на хромосоме, скажем, равно
Для первого гена: от 11 785 723 до 11 803 245 п.н.
Для второго гена: от 11 806 096 до 11 806 143 п.н. Эти значения включают также их регуляторные элементы, промотор и интроны.
Итак, какая последовательность присутствует между основаниями 11 803 245 и 11 806 096? Это спутниковые последовательности? Является ли эта некодирующая, нерегуляторная область гетерохроматином размером от 11 803 245 до 11 806 096 п.н.?
Нет. Межгенные области не обязательно представляют собой гетерохроматин. Конформации хроматина обычно имеют очень большой диапазон и обычно не ограничиваются одним геном. Распространение состояния хроматина можно предотвратить с помощью инсуляторов/пограничных элементов , которые опять же не являются частью транскрибируемой области. Межгенные области также могут содержать дистальные регуляторные элементы, такие как энхансеры и сайленсеры; они могут иметь микросателлиты, транспозоны и т.д. Чтобы узнать, какие все есть в конкретном регионе, вы можете просмотреть различные треки в браузере генома UCSC .
Короче говоря, между транскрибируемыми областями может быть функциональная и/или нефункциональная ДНК.
Повторяющиеся области не обязательно должны быть гетерохроматинизированы, и, наоборот, не все гетерохроматиновые области состоят из повторов.
WYSIWYG
Чарльз