Концентрация ДНК изопропанолом

Я читал, что ДНК можно концентрировать добавлением изопропанола.

Что значит «концентрированный»? Что изопропанол делает на молекулярном уровне для концентрации ДНК?

Ответы (1)

То, о чем вы спрашиваете, - это осаждение ДНК (или любой другой нуклеиновой кислоты) изопропанолом (или этанолом, что более распространено). Для этого вы добавляете соль (обычно слегка кислый ацетат натрия), которая обеспечивает насыщение фосфатного остова ДНК ионами натрия, что делает его менее растворимым. Затем вы добавляете органический растворитель, который осаждает ДНК из раствора, изменяя полярность раствора. Это заставляет ионы образовывать соли и осадки ДНК. Принцип объясняется в статье Википедии об осаждении этанолом . Наконец, раствор центрифугируют, чтобы собрать ДНК со дна реакционной пробирки и снять надосадочную жидкость.

Небольшое добавление: Изопропанол, имеющий большую алкильную группу, делает раствор более органическим по своей природе по сравнению с этанолом. Почему изопропанол, а не н-пропанол, возможно, потому, что изопропанол легко производить. н-пропанол лучше осаждает более мелкие нуклеиновые кислоты.
Это связано с тем, что изопропанол менее токсичен при обращении, чем н-пропанол. н-пропанол может вызвать серьезное повреждение глаз и, как правило, более токсичен, чем этанол или изопропанол.
Дело принято. но также легко производить изопропанол: P
Не говоря уже о том, что в каждой лаборатории молекулярной биологии есть изопропанол.
@ Крис .. Я не уверен, почему вы говорите, что н-пропанол более токсичен. Легко метаболизируется до пропионовой кислоты. В этой статье говорится, что изопропанол более токсичен с точки зрения длительного воздействия.
В основном это касается потенциального повреждения глаз н-пропанолом (брызгами). В этом MSDS говорится, например: «Попадание н-пропанола в глаза может вызвать сильное раздражение с повреждением роговицы, что может привести к необратимому ухудшению зрения, даже к слепоте».