Может ли интрон стать экзоном при альтернативном сплайсинге?

С этого изображениявведите описание изображения здесь

Мы можем видеть несколько экзонов, которые на самом деле являются интронами в других генах. На самом деле это не другой ген, это альтернативный сплайсинг гена. Мой опыт не связан с биологией, поэтому возможно ли, чтобы альтернативный сплайсинг вел себя так? Я только знаю, что альтернативный сплайсинг — это просто пропуск экзонов, а интроны просто останутся интронами, а не станут экзонами. Может ли кто-нибудь объяснить мне это и дать какие-либо предложения о том, какую часть биологии (или генетики) мне нужно изучить. Спасибо.

Я не уверен, что вы спрашиваете. Если часть последовательности оказывается в зрелой РНК, она по определению не является интроном.
Хм, ты прав. Итак, вы думаете, судя по этой картинке, что это просто пропуск экзона? Как называется такой ген? Его все еще называют изоформой? Мне трудно провести анализ секвенирования РНК для этого гена, потому что положение перекрытия ближе к концу может быть сопоставлено с геном 9.
Только что читал кратко. Кажется, что каждая форма находится под контролем своего промоутера. Это означает, что A8 должен будет сплайсировать первые экзоны всех других форм (это будет пропуск экзона). С другой стороны, пре-мРНК A1 изначально не содержит никаких других первых экзонов. Их можно было бы классифицировать как изоформы генов.
Спасибо. Не могли бы вы подсказать, где вы читали эти объяснения? Мои познания в биологии очень ограничены, поэтому мне нужно прочитать много материала, чтобы улучшить свои знания.
Большое спасибо. Итак, все эти гены будут иметь 4 общих экзона и отличаться только в первом экзоне, верно? Означает ли это, что если я могу подсчитать количество прочтений первого экзона, я могу оценить общее количество гена (например, UGT1A1). Потому что проблема в том, что результат для последних 4 экзонов неоднозначен.
Я мало что знаю об анализе данных секвенирования РНК, но мне это кажется правдоподобным.

Ответы (2)

Большинство расшифровок, которые вы показываете, имеют разные сайты начала транскрипции. Другими словами, это происходит из-за альтернативных сайтов начала транскрипции. Так что это не типичная альтернативная нарезка. Некоторые гены имеют разные стартовые сайты транскрипции, но в показанном вами случае стартовых сайтов исключительно много.

Если часть последовательности оказывается в зрелой РНК, она по определению не является интроном (за исключением случаев аномального сплайсинга и редкого удержания интрона).

Конкретно по вашему вопросу кажется, что каждая форма находится под контролем своего промоутера. Это означает, что A8 должен будет сплайсировать первые экзоны всех других форм (это будет пропуск экзона). С другой стороны, пре-мРНК A1 изначально не содержит никаких других первых экзонов. Их можно отнести к изоформам генов.

Использованная литература:

Оуэнс И.С., Басу Н.К., Банерджи Р. 2005. УДФ-глюкуронозилтрансферазы: генные структуры семейств UGT1 и UGT2. Методы Enzymol 400:1-22.

Ген NCBI: UGT1

Может ли интрон стать экзоном при альтернативном сплайсинге?
СпросиСетьПолитика конфиденциальности1y, 0v