Нужен ли ДНК-полимеразе I 3'3'3^\простой конец?

ДНК-полимераза III добавляет нуклеотиды в 5 ′ → 3 ′ направлении, потому что он может добавлять нуклеотиды только к 3 ′ конец предыдущего нуклеотида. Вот почему он требует грунтовки. Однако работает ли ДНК-полимераза I по тому же критерию? Требуется ли 3 ′ конец предыдущего нуклеотида, чтобы связать последующие нуклеотиды ДНК?

Если да , то как это сделать для фрагментов Окадзаки, когда каждый фрагмент Оказаки не связан друг с другом? Именно ДНК-лигаза катализирует фосфодиэфирную связь между 3 ′ конец 5 ′ начало двух фрагментов Окадзаки, не так ли?

Если нет , то при чем тут теломеры? После каждого события репликации ДНК ДНК становится все короче и короче на самых концах, потому что этот последний праймер может быть удален, но не заменен ДНК с помощью ДНК-полимеразы I, верно? Это наводит меня на мысль, что ДНК-полимеразе I требуется предыдущий нуклеотид. 3 ′ конец для работы, и это смутило меня в отношении его действия на фрагменты Окадзаки в сочетании с лигазой ДНК.

Ответы (1)

ДНК Pol I требует, чтобы 3'-конец предыдущего нуклеотида инициировал удлинение.

Что касается фрагментов Окадзаки, это достигается отжигом праймеров малых РНК с отстающей частью цепи репликационной вилки. ДНК Pol I удлиняет отстающую цепь от 3'-конца этих праймеров, создавая фрагменты Окадзаки. Позднее РНК-праймеры удаляются, оставляя промежутки между фрагментами Окадзаки, которые позже заполняются совместным действием ДНК PolI и ДНК-лигазы.

введите описание изображения здесь

В случае теломер окончательный РНК-праймер не может быть заполнен ДНК Pol I, потому что полимеразе требуется свободный 3'-гидроксил для присоединения первого нуклеотида ДНК. После удаления РНК-праймера первый нуклеотид ДНК должен быть присоединен к предшествующему ему нуклеотиду ДНК, чего не наблюдается в случае последнего праймера на теломере, поскольку он полностью находится на конце линейной цепи. .

В этом случае ДНК Pol I удаляет праймер РНК, который удаляется ДНК Pol I, но не может заменить его ДНК, оставляя пробел (шаг 6 на следующем изображении).

введите описание изображения здесь

ДНК Pol III участвует, но, насколько я могу судить, в настоящее время понимают, что Pol I заполняет промежутки между праймерами РНК на отстающей цепи, тем самым генерируя фрагменты Оказаки, в то время как Pol III в большей степени участвует в непрерывном удлинении. ведущей нити. Из этого обзора ( ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/21622658 ) видно, что Pol I и Pol III взаимодействуют во время удлинения ДНК способами, которые еще не полностью охарактеризованы, поэтому может иметь место некоторое пересечение.
@MarchHo - в любое время! :-)
Нужен ли ДНК-полимеразе I 3'3'3^\простой конец?
СпросиСетьПолитика конфиденциальности1y, 0v