Я изучаю белки, и мне нужно понять эту концепцию. Что делает этот разноцветный шар из закорючек узнаваемым? Почему именно белок, а не какая-либо другая биомолекула (например, ДНК)? Что показывают цвета? Каковы вариации формы изображения?
По сути, вопрос таков: что это изображение пытается сказать мне об этом белке?
Это распространенный способ изображения белка, который часто называют «мультфильмом о белках». Существуют и другие распространенные способы иллюстрации белков.
На этом рисунке показано, где находятся α-спирали (спирали) и где β-листы (стрелки), которые являются важными структурными элементами. Струны, соединяющие эти структурные элементы, представляют собой гибкие «петлевые» области.
Если вы хотите сравнить это с другими структурами и посмотреть, какой это белок, проверьте PhyreStorm. Вам понадобится файл PDB, а не просто изображение.
Окраска также распространена. N-конец (первая аминокислота) окрашен в синий цвет, а цвета переходят от радуги к красному, С-концу (последняя аминокислота в полипептидной цепи).
Несмотря на то, что на этот вопрос был дан ответ (и ответ принят), я хочу добавить кое-что относительно научного языка и условностей.
Язык в целом является средством общения, которое позволяет людям делиться идеями, которые у них есть в голове. Научный язык используется для обмена научными знаниями между людьми, и кроме устного и письменного общения, он также использует всевозможные рисунки для лучшей иллюстрации сложных идей, обычно невидимых невооруженным глазом (будь то речь идет о молекулах в химии, биологической микросистемы в биологии, силы в физике и др.).
Рассматриваемое изображение представляет собой традиционный способ изображения структуры белка, и это широко распространенное соглашение характеризуется определенными цветами и формами, как указано в ответе выше. Я полагаю, что любой, кто впервые увидит такое представление, не сразу поймет, что это компьютерная версия белка, потому что никто не знает, как выглядит отдельный белок, пока не изучит его. Но как только вам говорят, что это представление белка, вы принимаете его и « отмечаете » его в своем уме, чтобы в следующий раз, когда вы его увидите, вы уже знали, как белок «должен» выглядеть.
И чем больше вы его изучаете, тем более естественным становится для вас этот язык.
Джеймс
МэттДмо
Жиллен
Джеймс