Сервер для прогнозирования структуры белка для нескольких последовательностей

Есть ли у кого-нибудь идеи о каком-либо онлайн-сервере, который принимает несколько аминокислотных последовательностей в формате fasta и выводит трехмерную структуру входных аминокислотных последовательностей в виде спирали, листа и клубка? Я искал, но ничего не нашел. Есть сервера, которые принимают в 1 последовательности. Я хочу получить структуру нескольких последовательностей вместе...

Почему вы хотите, чтобы несколько последовательностей вместе? В чем проблема сделать одно за другим? Есть ли какой-то дополнительный аспект, который не очевиден в вопросе?
количество белков огромно, поэтому я хотел знать, есть ли какой-либо веб-сайт, на котором разрешена пакетная обработка
Я уверен, что какой-то API будет существовать. Какой сервер вы используете? Вы проверяли его руководство? Вы также можете написать сценарий, который может выполнять по одному отправке и поиску.
Также, когда у вас много данных, вы должны получить программу, а не тратить время на сервер.
@Mithoron с такими данными и вычислениями, это легче сказать, чем сделать
@Maljam Какой? Это не похоже на то, что ОП специально просит получить нативную структуру со 100% точностью.

Ответы (2)

К сожалению, невозможно предсказать третичную структуру белков, используя необработанную аминокислотную последовательность. Информация, необходимая для расчета при построении динамической формы белка, в настоящее время слишком велика для любого компьютера.

На самом деле существует целый список исследовательских центров, которые ищут людей, готовых пожертвовать временем простоя процессора своего компьютера, чтобы помочь секвенировать белки.

Вот список: ( http://www.hyper.net/dc-howto.html ).

Меня действительно не волнует, кому сейчас нужны простаивающие компьютеры. Мне нужно знать, существует ли такой сервер или нет
Люди над этим работают. Так что нет, не знают.
Другими словами, OP должен искать базы данных белков, которые можно индексировать с помощью последовательностей аминокислот или ДНК.
Это невозможно сделать точно , но такие серверы делают это более или менее точно, ОП не спрашивал, была ли внезапно решена проблема сворачивания белка.

Если вы ищете только предсказание вторичной структуры, вы можете попробовать API JPred-сервера.

На своем веб-сайте они ссылаются на сценарий, который

предоставляет пользователю JPred расширенные функциональные возможности для удобной отправки сотен заданий JPred устойчивым образом. […] Для получения полной информации о коде, инструкциях и загрузке, пожалуйста, посетите страницу репозитория Fabian GitHub .

Сервер для прогнозирования структуры белка для нескольких последовательностей
СпросиСетьПолитика конфиденциальности1y, 0v