Рестриктазы типа II [закрыто]

Почему фермент рестрикции II типа не может разрезать нуклеиновую кислоту со следующим основным составом:

А: 28% С: 15% Г: 35% Т: 22%

Я не очень понимаю ваш вопрос... Во-первых, рестриктазы разрезают по сайту узнавания, я никогда не слышал о распределении содержания оснований (можно ссылку на источник?) Во-вторых, в любой последовательности ДНК процент А равен проценту процент T, и то же самое верно для C и G. Какой король последовательности ДНК может иметь 28% T и 22% T? Значит, вы говорите о РНК. Но тогда T неправильный, он должен быть U. Пожалуйста, добавьте больше деталей к вашему вопросу.
Добро пожаловать в Biology.SE. Для меня это вопрос домашнего задания (здесь они не по теме, см. ссылку), поэтому я поставил на него флажок. Пожалуйста, приложите усилия, чтобы ответить на вопрос самостоятельно, если вы хотите избежать удаления/закрытия вопроса. Что вы знаете о ферменте? Что базовая композиция говорит вам о рассматриваемой последовательности? В общем, дайте нам знать, что вы пытаетесь. Спасибо!

Ответы (1)

Я полагаю, это домашнее задание, а не искреннее любопытство. В таком случае я дам вам два разных ответа: стандартный, который, как я полагаю, ожидает увидеть ваш учитель/лектор, и более сложный в приложении .

Первое, на что обращают внимание в вопросе, — это базовые проценты. Ясно, что она не следует известному правилу спаривания Уотсона-Крика (А соединяется с Т, G соединяется с С), и поэтому мы не видим правила Чаргаффа в этой нуклеиновой кислоте.

Таким образом, это не двухцепочечная ДНК (дцДНК), а одноцепочечная ДНК (оцДНК).

При этом ответ на этот вопрос может быть примерно таким:

RE типа II не может разрезать эту нуклеиновую кислоту, потому что это одноцепочечная ДНК.

Приложение:

Здесь есть осложнение, которое может сделать предыдущий ответ сомнительным.

Ферменты рестрикции типа II расщепляют только обычные , то есть двухцепочечные ДНК. Таким образом, они не могут расщеплять оцДНК, что подтверждает ответ, который мы только что дали.

Но проблема в том, что оцДНК могут образовывать петлевые структуры, в которых происходит спаривание между основаниями в одной цепи. В этих структурах ДНК технически представляет собой двухцепочечную ДНК и, как таковая, может быть расщеплена RE типа II. Например, взгляните на эту статью: Эндонуклеазы рестрикции II типа расщепляют одноцепочечные ДНК в целом .

При этом RE типа II действительно расщепляют оцДНК (в местах, где оцДНК образует петли и структурно напоминает двухцепочечную ДНК), что делает сам вопрос бессмысленным.

На самом деле это домашнее задание, базовый процент возможен только в том случае, если он относится к одноцепочечной ДНК. Следовательно, может ли ответ быть связан с палиндромами? Хотя мы ничего не можем сказать о сайте распознавания
Я думаю, что стоит пояснить, что, по крайней мере, согласно статье, на которую есть ссылка в ответе, наблюдаемое разрезание одноцепочечной ДНК фага связано с образованием двухцепочечной ДНК в структурах «стебель-петля». Это может показаться педантичным, но ясно, что с точки зрения ферментов рестрикции субстратом по-прежнему является двухцепочечная ДНК.
Рестриктазы типа II [закрыто]
СпросиСетьПолитика конфиденциальности1y, 0v