Биологическое значение корреляции между радиусом инерции и числом слоев выпуклой оболочки белковой структуры

Просматривая статью под названием «ГЕОМЕТРИЧЕСКИЙ АНАЛИЗ КОНФОРМАЦИОННЫХ ОСОБЕННОСТЕЙ БЕЛКОВЫХ СТРУКТУР» Маниша Датта, я узнал, что существует корреляция между радиусом инерции и количеством слоев выпуклой оболочки каждой трехмерной структуры белка (выпуклая слои оболочки формируются путем формирования выпуклой оболочки набора точек, образующих первый слой, затем их удаления и пересчета другого набора граничных точек, ii, второй выпуклой оболочки, образующих второй слой).

Теперь мой вопрос: каково биологическое значение этой корреляции? Или есть?

Что такое «слой» выпуклой оболочки? Насколько я знаю, есть только один слой оболочки (минимальная ограничивающая поверхность, содержащая все точки)
Неважно, я предполагаю, что вы можете вкладывать корпуса, удаляя точки на внешнем корпусе и пересчитывая. Все еще стоит описать это в вашем вопросе, я думаю
@gilleain Я отредактировал вопрос. Надеюсь, теперь вы это понимаете...

Ответы (1)

Прочитав статью, я не вижу никакого очевидного биологического значения. В аннотации сказано:

Белки демонстрируют интригующее разнообразие своих трехмерных конформаций, что позволяет им выполнять различные функции.

Это здорово, но в этой статье нет связи между конформацией и функцией — неудивительно, поскольку это большая часть структурного анализа белка!

То, как я смотрю на эту работу, похоже на идею «дескриптора» из области хеминформатики. Радиус вращения является дескриптором, как и этот номер корпуса. Автор утверждает, что между этими двумя дескрипторами существует корреляция, так что... легче ли вычислить один, чем другой?

Это интересная работа, но я пока не уверен, какое значение имеет номер оболочки для структурного анализа белка. Однако я могу сказать, что корреляция между этими двумя дескрипторами не является биологически значимой — это просто геометрическая взаимосвязь, которая предположительно будет иметь место для любого набора трехмерных точек.