Сколько различных видов полипептидов, каждый из которых состоит из 12 аминокислот, можно синтезировать, используя 20 обычных аминокислот?

Судя по тому, что вы сказали, я предполагаю, что комбинаторика для вас не проблема.

Я полагаю, ваша проблема в том, что вы думаете, что Glu-(Met)x11 эквивалентен (Met)x11-Glu, только что перевернулся. Однако это не правильное мышление. Аминокислоты не являются симметричными молекулами, поэтому обратная линейная комбинация не создает перевернутую (хиральную или нет) форму аналогичной аминокислоты. Я предполагаю, что вы пишете названия аминокислот последовательно, когда представляете пептиды. У этого метода есть небольшая проблема, заключающаяся в том, что он не учитывает направленность молекул. Рисование всей молекулы может быть решением, но это слишком хлопотно.

Мое решение состоит в том, чтобы добавить небольшую метку (возможно, стрелку или метку >), чтобы обозначить конкретную сторону молекулы аминокислоты (группу амина или карбоксильную группу), чтобы зеркально отразить последовательность (чтобы метка находилась на конце). «другая» сторона каждой аминокислоты) фактически создаст молекулу пептида, отличную от обратной последовательности (так что метка все еще будет на «нормальной» стороне каждой аминокислоты). Если вы считаете, что это выглядит не очень хорошо, вы можете нарисовать рамку вокруг каждой аминокислоты, где одна сторона аминокислоты имеет вмятину, а другая сторона имеет выпуклость (для представления аминогруппы и карбоксильной группы), так что только выпуклая сторона может соединяться с помятой стороной. Зеркальное отображение последовательности также изменило бы положение выпуклостей и вмятин,

Думайте о выборе аминокислот как о 12 местах. На первом месте у нас есть 20 вариантов. На следующем месте у нас есть 20 вариантов, и это продолжается. Следовательно, мы имеем это

До сих пор мы рассматривали последовательность аминокислот, из которых состоит белок. Это первый из нескольких уровней структуры белка, показанных на рис. 4.4. Последовательность аминокислот в белке является его первичной структурой. Последовательность аминокислот в конечном итоге определяет, как складывается белок [1] .

Отдельные аминокислоты несимметричны. Таким образом, два ваших примера пептидов химически не эквивалентны, и$20^{12}$цифра правильная.