Я видел, что тирозин классифицируется как гидрофобная аминокислота из-за его ароматического кольца в некоторых учебниках и как гидрофильная из-за его гидроксильной группы в других учебниках. Как на самом деле функционирует тирозин в пептиде в физиологических условиях (полярная водная среда и рН ~7)?
Ответ на этот вопрос появляется при изучении структуры тирозина или, точнее, остатка тирозила, как он существует в белках, что касается вопроса:
Он обладает как гидрофобными, так и гидрофильными свойствами и может проявлять оба поведения в зависимости от обстоятельств.
Кольцо ароматическое и гидрофобное, но гидроксильный заместитель гидрофильный.
Важно не пытаться подгонять вещи под жесткие классификации, которые могут им не подходить. Действительно, следует задаться вопросом, насколько полезна та или иная классификация в любых обстоятельствах, и осознавать ее ограничения.
Классической иллюстрацией важности этих двойных свойств тирозина является описание Перутцем различий между окси- и дезокси-структурами гемоглобина, где оксигенация гема вызывает перемещение тирозина из гидрофобной внутренней части белка в гидрофильную. поверхность. Это движение связано с разрывом ионных связей между субъединицами при общем изменении четвертичной структуры:
(Это модифицированная версия рис. 3 оригинала, созданная много лет назад в учебных целях. Волнистая линия представляет собой мультяшное изображение полипептидной цепи α-субъединицы гемоглобина между His-F8 и C-концевым Arg. Для ясности предыдущая область не показана, но ее продолжение обозначено стрелкой.)
Тирозин (Tyr или Y, 4-гидроксифенилаланин) обычно называют полярной аминокислотой, потому что его гидроксильная группа (полярная скорее гидрофильна), но есть одна загвоздка с бензольным кольцом и стэкинговыми пи-пи взаимодействиями.
Поэтому многие авторы просто помещают этот аа в «середину». Но другая часть вашего вопроса намного сложнее.
Прежде всего нужно знать, что аминокислоты могут вести себя как цвиттерионы . В основном это состояние, при котором аминогруппы и карбоксильные группы в аминокислоте заряжены поровну. Это состояние описывало изоэлектрическую точку , которая представляет собой значение Ph, где аминокислота присутствует в виде цвиттер-иона. Изоэлектрическая точка Tyr равна 5,66 Ph. Значит, в 7 Ph он все равно будет заряжен.
Краткое резюме химии: Тирозин представляет собой полярную аминокислоту, которая является гидрофильной или гидрофобной в зависимости от условий.
Для биологического применения тирозин хорошо подходит для фосфорилирования и других модификаций группы -ОН на бензольном кольце С4. Но в основном зависит от обстоятельств, как поведет себя тирисил в пептидах.
Л.Диаго
канадец