Транскрипция ДНК в мРНК с помощью интронов

У меня есть проблема на уроке биоинформатики, которую я думал, что делаю правильно, но кто-то другой получает другой ответ. Вот проблема:

Учитывая следующую последовательность ДНК, 5'-GGATCGTGCCACCATCCACCATCGTTA-3', если два интрона находятся в основаниях 3-9 и 15-22, какая мРНК транскрибируется? Дайте ответ от 5' до 3'. Обратите внимание, что первое основание равно 1.

И вот шаги, которые я предпринял:

  1. 5'-GG ATCGTGC CACCA TCCACCAT CGTTA-3' (удалить жирный шрифт)
  2. 5'-GGCACCACGTTA-3' (новая строка)
  3. взять обратное дополнение
  4. поменять местами T с U

Это верно? Или где я ошибаюсь?

Если вы посмотрите на ensembl.org, которым пользуются настоящие биологи, последовательность ДНК, указанная для гена, и последовательность ДНК, указанная для транскрипта, будут одинаковыми, если ген работает в прямом направлении. Они не рассчитаны на обороты; люди даже не заменяют U в последовательностях. Так что просто имейте в виду, что часть того, что вы делаете, нужно просто доказать, что вы действительно знаете, что РНК имеет U, что существует разница между матричной и кодирующей цепями... настоящие биологи принимают это как должное.

Ответы (1)

Я думаю, что единственное место, где вы ошибаетесь, - это запутаться в нитях («взять обратное дополнение»).

5'-GGATCGTGCCACCATCCACCATCGTTA-3'   << coding strand
3'-CCTAGCACGGTGGTAGGTGGTAGCAAT-5'   << template strand

Кодирующая цепь имеет ту же последовательность , что и транскрибируемая РНК (кроме T>U), поэтому первичный транскрипт:

5'-GGAUCGUGCCACCAUCCACCAUCGUUA

Затем позиции интронов:

5'-GG AUCGUGC CACCA UCCACCAU CGUUA

и после склеивания:

5'-GGCACCACGUUA
Принимаете ли вы обратное дополнение после сплайсинга? Похоже, мы получили тот же результат, я просто взял обратное дополнение и перевернул Т на последний U
Вам не нужно использовать обратный комплемент - «верхняя» цепь ДНК (то есть последовательность в вашем вопросе) имеет ту же последовательность, что и РНК, потому что РНК создается с использованием комплементарной цепи в качестве матрицы. Я включил «нижнюю» прядь для ясности.
Транскрипция ДНК в мРНК с помощью интронов
СпросиСетьПолитика конфиденциальности1y, 0v