Влияние соотношения полов на эффективный размер популяции

Как указано в этой статье в Википедии, эффективный размер населения Н е когда соотношение полов отличается от 1 2 является

Н е знак равно 4 Н м Н ф Н м + Н ф

Я понимаю, что предвзятое соотношение полов уменьшает эффективный размер популяции, и формула довольно проста. Однако мне не удалось бы доказать, что эта формула верна.

Можете ли вы продемонстрировать мне, что Н е знак равно 4 Н м Н ф Н м + Н ф правда?

Ответы (1)

Причина того, что неравное соотношение полов влияет на эффективный размер популяции, заключается в том, что потомство производится одним родителем мужского и одного женского пола, а неравное соотношение полов увеличивает скорость, с которой будет происходить генетический дрейф.

«…меньшее количество самцов по-прежнему вносит половину генов в следующее поколение…»

Другими словами, если предположить, что мужская популяция меньше, гены, передаваемые мужчинами/отцами, берутся из меньшей популяции, чем у женщин/матерей. Как известно, небольшие популяции более склонны к дрейфу.

Представьте классический пример дрейфа с мешком синих и красных шариков, но представьте себе родительское поколение с неравным количеством шариков в каждом мешке.

Хартл и Кларк иллюстрируют (см. рис. 4 здесь ) взаимосвязь между соотношением полов и эффективным размером популяции, где соотношение полов 1:9 дает эффективный размер популяции около 36% от фактического размера (данного 100 × ( Н е / Н ) ). Это означает, что уровень инбридинга и дрейфа в очаговой популяции эквивалентен уровню идеализированной популяции , которая в 0,36 раза превышает численность очаговой популяции по данным переписи.

Н е знак равно 4 Н м Н ф Н м + Н ф знак равно 4 × 1 × 9 1 + 9 знак равно 3,6

Популяция диплоидная и раздельнополая ; каждый родитель несет два гена, и каждый родитель должен быть заменен в популяции, поэтому каждая пара должна производить двух потомков. Рассмотрим случай, когда Н м знак равно Н ф знак равно 1 (и поэтому Н знак равно Н е знак равно 2 ). Число генов в этой популяции равно четырем. Следовательно, чтобы поддерживать тот же размер популяции, четыре гена должны быть взяты из наследственной популяции.


Дальнейшее чтение:


Хотя (лично) я не могу доказать это математически, я могу продемонстрировать это с помощью моделирования. Я написал симулятор генетического дрейфа в R , который может справиться с неравным соотношением полов.

Первые четыре графика — это популяции с Н Е знак равно 360 при различном соотношении полов ( Н М / Н Ф = 0,11, 0,33, 0,67, 1,00) для 100 повторных популяций, смоделированных в течение 80 поколений, с начальной частотой аллеля 0,2. Четыре моделирования имеют разный размер переписи населения, но одинаковую эффективную численность населения из-за соотношения полов. Четыре группы популяций ведут себя одинаково (скорости дрейфа одинаковы для смоделированных популяций в различных условиях).

введите описание изображения здесь

Эти четыре используют более крупные популяции ( Н × 15 ), при тех же соотношениях полов, где Н Е знак равно 5400 во всех случаях моделируется более 400 поколений. И снова группы симуляций ведут себя одинаково.

введите описание изображения здесь


Обновлять:

Я добавил гистограммы, чтобы облегчить просмотр паттерна, используя п знак равно 0,5 , для 1000 популяций, смоделированных в течение 25 поколений, где Н Е знак равно 360 и соотношение размера и пола переписного населения варьируется в зависимости от моделирования. Это распределение похоже, несмотря на разную численность переписного населения.

введите описание изображения здесь

Спасибо за ваш ответ. Как указано в посте I understand the biased sex-ratio decreases the effective population size. Я не могу доказать, что Н е знак равно 4 Н м Н ф Н м + Н ф верно (пока Н е знак равно ( Н м Н ф ) 2 4 ( Н м + Н ф ) например неправильно)
Хм... нет, это не совсем помогает. Я ищу математическое доказательство того, что Н е знак равно 4 Н ф Н м Н ф + Н м . Другими словами, я ищу математическое доказательство того, что скорость потери гетерозиготности в популяции с Н м мужчины и Н ф самки такие же, как популяция Райта-Фишера с Н знак равно 4 Н ф Н м Н ф + Н м (по определению пораженной популяции Н е ).
@Remi.b внес некоторые изменения, но я не доказываю математически
Ух ты. Вы определенно заслуживаете +1 за все это. Спасибо
спасибо - я обновил сценарии (доступные на связанной странице), чтобы указать соотношение полов, а не Н М а также Н Ф и он показывает это с меньшим количеством повторяющихся популяций, на что немного приятнее смотреть - здесь я сделал 100 повторений, чтобы показать общую тенденцию (то есть, как траектории распространяются с течением времени), но это довольно уродливо смотреть на