Я из тех биологов, которые мало знают о молекулярной генетике и динамике биохимических реакций.
Вопрос
Мой вопрос касается влияния температуры на динамику молекулярно-генетических процессов. Как правило, я хотел бы знать, как (количественно говоря, поиск например) следующие параметры изменяются в зависимости от температуры.
Почему я задаю этот вопрос?
Чтобы узнать, какие значения параметров по умолчанию я должен ввести для целей моделирования в эволюционной биологии. Несмотря на то, что наша область обширна, мы решили, что будем рассматривать значения параметров, которые наблюдаются в дрожжах.
Это звучит просто, если подумать, но найти веские доказательства на самом деле не так просто. Поскольку это слишком долго для комментария, я должен поместить его в качестве ответа. Несколько соображений: все ферментативные реакции, конечно же, зависят от температуры и обычно имеют температурный оптимум при определенных температурах жизни. Для дрожжей это около 27°C, для термофилов — намного выше. Для транскрипции помимо более высокой активности одного фермента важную роль играет ряд других факторов, включая доступность хроматина и наличие кофакторов. Эта статья может быть вам интересна: « Прямое измерение скорости транскрипции выявило несколько механизмов конфигурации реакции арабидопсиса на температуру окружающей среды ».
Связывание ДНК должно представлять собой статистический процесс между ассоциацией и диссоциацией в данном месте связывания. При более высоких температурах оборот в месте связывания должен быть выше (поскольку имеется больше энергии для ускорения диссоциации). Т
Реми.б
Крис