Значение «Оценка» в ScanProsite

Я занимаюсь исследованием белка, который секвенирован, однако я не могу найти никакой информации о баллах, которые показывает сканирование ProSite после нахождения возможного профиля домена. Я прочитал справку на сайте , однако там нет ничего, что объясняло бы, что означает оценка.
введите описание изображения здесь

Ответы (1)

Оценка показывает, хорошо ли конкретный профиль (который представляет собой весовую матрицу) соответствует профилю домена. Раздел II.Б. Разработка профилей объясняет это более подробно.

В документе, в котором описывается развитие PROSITE, отмечается, что они в основном используют пороговое значение 8,5, и таким образом объясняется оценка;

необработанные баллы в профилях PROSITE преобразуются в так называемые «логарифмы 10 на остаток E-значения», что позволяет вычислить количество ожидаемых совпадений с равным или более высоким баллом в базе данных заданного размера. Например, ожидается, что совпадение с нормализованной оценкой 9,0 или выше произойдет примерно один раз в базе данных из одного миллиарда остатков .

Почему это не просто E-значение, как в BLAST? Я читал ваши ссылки, но я не могу понять это. Вы знаете, как это рассчитывается? @Майкл_А
В документе, на который я ссылался, описывается, как рассчитываются E-значения, а также объясняется, почему они использовали этот подход.
Значение «Оценка» в ScanProsite
СпросиСетьПолитика конфиденциальности1y, 0v