Как ген «знает», на что нужно измениться?

Извините за невежество, но меня всегда интересовал этот вопрос...

Например, лягушка красная, но начинает жить в зеленом лесу. Со временем лягушка становится зеленой для маскировки. Но ген не может видеть, и я уверен, что не существует механизма передачи информации о цвете отдельным генам из мозга. Так как же ген знает, что лучше предпочесть зеленый, скажем, синему?

Цветовая адаптация не связана с изменениями в генах. Почему вы предположили это, я действительно не знаю, но это делает бессмысленным ваш вопрос. Если вы хотите узнать, как работает цветовая адаптация, перефразируйте свой вопрос соответствующим образом. Но, пожалуйста, никогда не задавайте вопросов, применяя слово «знаю» к неодушевленным объектам. Потрудитесь выражаться по-научному.
@David: вы говорите, что вопрос «ерунда», но у него есть несколько голосов и очень хорошие ответы, пять из них на момент написания. Я также хотел бы знать, что значит «выражаться по-научному»; и обязательно ли задавать вопрос?
@David - просто спасибо за бдительность и за ваши усилия по контролю общего качества сайта. Сказав это, я также хочу поделиться тем, что ваши комментарии здесь получают флаги [общий тон, грубый, оскорбительный, йадия, вы знаете...].
@MartinArgerami - большое количество голосов, а также большое количество ответов больше связано с тем, что вопрос попал в список горячих вопросов, чем с его качеством. На самом деле, вопрос также был отклонен 4 раза. Тот факт, что некоторые люди (например, Реми) очень хорошо умеют генерировать отличные ответы, не отменяет того факта, что сам вопрос свидетельствует об определенной ненаучности.
@MartinArgerami — Пожалуйста, прочитайте то, что я написал, что разговоры о «знании генов» делают вопрос бессмысленным. Поскольку гены не являются разумными существами, эта фраза бессмысленна, и если у вас есть вопрос (который может иметь некоторую ценность), включение бессмысленных выражений делает его недействительным или «делает бессмысленным». Этого можно избежать, если идея, которую плакат хочет выразить, оформлена в научной манере. Я не понимаю, что означает плакат, но примером научного выражения может быть: «Есть ли способ, которым электрические сигналы мозга могут вызывать мутацию генов определенным образом?».
Как написано, вопрос касается изменения цвета в течение жизни человека, но ответ, получивший наибольшее количество голосов, обсуждает изменение цвета популяции в результате эволюции. Вопрос должен быть закрыт как неясный до тех пор, пока спрашивающий не разъяснит его.
@canadianer - я полностью согласен, но клянусь против закрытия мода :) Главный ответ теперь в основном гласит - ваш вопрос основан на неверном предположении, что у гена есть мозг.
Педантичность здесь абсурдна. ОП, очевидно, знает, что «знать» - неправильное слово, поэтому они взяли его в кавычки. Не зная, как к этому относиться или как работает мутация, вот почему они здесь . «Вы невежественны и пишете чепуху» — неподходящий ответ тому, кто пытается учиться. А сайт вопросов и ответов, наверное, не лучшее место для тех пользователей, которых не интересуют ни вопросы, ни ответы.
Уместно ли здесь прерывистое равновесие ? Я удивлен, что никто не упомянул об этом... но я и не биолог, так что...
Я задал первоначальный вопрос (система не позволяет мне писать в разделе комментариев). Я не могу поверить, как быстро это переросло в спор о семантике вопроса. Если вы разбираетесь в науке и особенно. биология не очевидно, что гены знают что-нибудь? Даже я это знаю, а я не ученый. Я очень четко заявил, что не разбираюсь в этом вопросе, отсюда и вопрос. Если бы мы знали, как правильно задавать все правильные вопросы, мы были бы намного более продвинутыми как биологический вид. В любом случае, я ценю всех, кто отложил семантику в сторону и ответил на вопрос. Спасибо, это мю

Ответы (8)

Используя ваш пример, ген ничего не знает. Мутации приводят к тому, что некоторые потомки красной лягушки становятся зелеными, некоторые - синими, некоторые - флуоресцентно-желтыми, а некоторые остаются красными. Птицы не видят зеленых так же хорошо, как и других, поэтому больше зеленых лягушек выживает и производит больше зеленых лягушек. Красные лягушки, флуоресцентные желтые, синие лягушки в основном съедаются. Через несколько поколений почти все лягушки стали зелеными — не потому, что ген что-то знал, не потому, что мутации пошли в любом направлении, а потому, что все другие изменения были контрпродуктивными и были съедены.

Ген ничего не знает. Это просто набор химических веществ, которые беспорядочно реагируют с космическими лучами, случайностью, чем угодно. Большинство изменений несущественны или явно вредны, и лягушка, несущая эти конкретные химические вещества, не выживает. Но иногда изменение приносит пользу лягушке, несущей определенные химические вещества, и тогда лягушка отправляет эти химические вещества своему потомству.

Очевидно, что это сильно упрощено. Краткое и простое введение в основы эволюции — « Понимание эволюции » Калифорнийского университета в Беркли.

Это хороший ответ, но я просто хочу добавить, что этот процесс называется « естественным отбором » и подпитывается «давлением отбора».
Кроме того, в действительности потомство одной лягушки будет чуть более зеленым, чуть более голубым или чуть более флуоресцентно-желтым. (Хотя у некоторых может быть мутация, из-за которой их окраска вообще не работает, поэтому они становятся альбиносами). Пройдет много поколений, прежде чем вы сможете увидеть зеленую, синюю или желтую лягушку. (Если его зеленые, синие или желтые предки не были убиты хищниками первыми)
@immibis: Не обязательно. Зеленый ген мог быть рецессивным и изначально редким. Это даже не потребовало бы мутаций, это просто было бы вопросом исчезновения доминантных красных генов из-за хищничества.
Если самки лягушек не предпочитают спариваться с красными лягушками, то зеленым лягушкам не повезло, и лягушки, скорее всего, вымрут, а не «эволюционируют», чтобы стать зелеными.
@Peter: ... хотя те самки лягушек, которые не так сильно предпочитают красных товарищей, в среднем будут иметь более зеленое потомство, и поэтому больше их потомков женского пола выживет, чтобы снова спариваться. Таким образом, предпочтения самок со временем тоже будут меняться, если, конечно, лягушки не вымрут первыми. (Но события, близкие к вымиранию, имеют тенденцию ускорять отбор, поскольку последние несколько выживших лягушек, вероятно, будут самыми зелеными.) Более серьезная потенциальная проблема заключается в том, что если есть постоянный приток красных лягушек, мигрирующих из другой среды обитания, это затруднит закрепление зеленой субпопуляции.
Честно говоря, я не совсем уверен, что это отвечает на вопрос. Когда в последний раз кто-нибудь видел, скажем, зеленого оленя? Если цвета меняются случайным образом и это просто вопрос выживания, то наверняка кто-то должен время от времени замечать случайно окрашенных животных. Самое близкое, что я когда-либо видел, это белые жирафы, у которых просто нет пигментов. Так что непрофессионалу легко не поверить в естественный отбор. Я думаю, если вы хотите, чтобы этот ответ был убедительным, вы должны указать некоторые цифры относительно того, как часто вы ожидаете увидеть странные мутации, если вы, вероятно, будете наблюдать изменение, которое может быть выбрано в течение N лет.
Второй @Mehrdad, плюс: как насчет хамелеонов?
Но флуоресцентных лягушек не едят, потому что птицы считают их ядовитыми...
Это теория эволюции через случайность. Это не объясняет изменений, которые требуют 2-3 основных одновременных изменений для выживания мутировавших животных. Затем начинаешь задумываться, действительно ли эволюция происходит случайным образом.
@akstadinov, если вы действительно не понимаете эту простую концепцию, задайте другой вопрос, и кто-нибудь объяснит вам. Комментарии — неподходящее место для новых вопросов (или для старых и давно опровергнутых утверждений).
@iayork, я не вижу вопроса в своем комментарии. Я пытался указать на слабое место в вашем ответе. Или, может быть, whateverв вашем ответе есть вещь, которую гораздо сложнее объяснить.
@akstadinov (или делать старые и давно опровергнутые утверждения) - я давал вам презумпцию сомнения и предполагал, что вы можете быть действительно невежественными, но, поскольку вы сначала как попугай повторили давно опровергнутую точку зрения креационистов, а затем ответили классическим креационистским запутыванием , я просто укажу (на случай, если новички будут одурачены), что это "слабое место" не является чем-то подобным и представляет собой хорошо изученное понятие, хотя креационисты постоянно пытаются соврать об этом.
@iayork, пока вы не предоставляете доказательств, ваша позиция является просто мнением или убеждением. Хотя некоторые наивные формы «креационизма» оказались ошибочными, это никоим образом не доказывает теорию «случайной» эволюции. Теория «случайности», на мой взгляд, столь же наивна, как и некоторые теории «креационизма», и никогда не была научно доказана. Больше ничего писать не буду. Любой, кто может думать и читать, может продолжать исследовать и думать самостоятельно.

Цвет каждого потомства немного отличается от его родителей. Некоторые цвета помогают лягушке выжить, другие цвета, как правило, убивают ее до того, как она размножится. Со временем вид склоняется к цвету, который улучшает выживаемость, потому что те, которые лучше подходят для своей среды, будут размножаться, а те, которые хуже подходят для своей среды, размножаются с разной скоростью.

Как это отвечает на вопрос, явно связанный с молекулярными механизмами, даже несмотря на ошибочные предположения? Все, что вы говорите, это «так бывает».
@ Дэвид Я не думаю, что вопрос касается молекулярных механизмов, я думаю, что спрашивающий просто не понимает, как работает эволюция, в частности, генетические вариации / мутации.
@BryanKrause — Кто знает? Но ответ ужасен независимо от вопроса. Вопрос явно неясен и должен быть закрыт, если кто-то его не отредактирует. Вам не кажется?
Я думаю, что этот ответ просто прекрасен. Это не идеально, и я думаю, что ответ @iayork более точен в формулировках, но этот ответ выигрывает от того, что он краток, по существу и доступен для кого-то, кто действительно плохо знаком с эволюцией, как, кажется, ОП. Это намного лучше, чем ваш комментарий « Цветовая адаптация не связана с изменениями в генах », что явно неверно, конечно, адаптация связана с изменениями в генах, но не так, как думал ОП.
И хотя исходный вопрос показывает плохое понимание, я не уверен, что это действительно ужасный вопрос. Я думаю, что почти наверняка где-то есть дубликат, чтобы закрыть его, но мышление и логика ОП четко отображаются, и они не просят ответа, который был бы слишком широким или подробным для этого сайта.

Конечно, как известно, ген не имеет никакого сознания, ген ничего не знает. Это всего лишь набор химических реакций.

Центральная дилемма

Во-первых, вы должны понимать, что ген — это часть ДНК, которая будет транскрибироваться в мРНК, а мРНК будет транслироваться в белок (это некоторое упрощение). Белок – это молекула, вызывающая действие. Концентрация белков в клетке играет ключевую роль в возникновении фенотипического эффекта.

Регуляторные механизмы

На концентрацию белков могут влиять многие регуляторные механизмы.

Регуляция экспрессии генов

Регуляция экспрессии генов включает широкий спектр механизмов, которые используются клетками для увеличения или уменьшения продукции специфических генных продуктов (белков или РНК), и неофициально называется генной регуляцией. Сложные программы экспрессии генов широко используются в биологии, например, для запуска путей развития, реагирования на стимулы окружающей среды или адаптации к новым источникам пищи. Можно модулировать практически любой этап экспрессии генов, от инициации транскрипции до процессинга РНК и посттрансляционной модификации белка. Часто один ген-регулятор контролирует другой и т. д. в сети регуляции генов.

Посттранскрипционная регуляция

Посттранскрипционная регуляция представляет собой контроль экспрессии генов на уровне РНК, то есть между транскрипцией и трансляцией гена. 1 Он вносит существенный вклад в регуляцию экспрессии генов в тканях человека.

К ним относятся такие механизмы, как

  • укупорка
  • соединение
  • Добавление поли(А) хвоста
  • Редактирование РНК
  • мРНК стабильность

Посттрансляционное регулирование

Посттрансляционная регуляция относится к контролю уровней активного белка.[..] Она осуществляется либо с помощью обратимых событий (посттрансляционные модификации, такие как фосфорилирование или секвестрация), либо с помощью необратимых событий (протеолиз).

Изменение цвета кожи у лягушек

Должен быть задействован один такой регуляторный механизм.

Я действительно мало знаю о физиологии и молекулярной биологии, но я мог найти большое количество статей (включая Taylor and Hadley 1969 и Fernandez and Bagnara 1991 ), показывающих, что изменение цвета опосредовано выработкой меланофор-стимулирующего гормона (МСГ). вырабатывается гипофизом. Возможно, лучший физиолог/молекулярный биолог мог бы дать вам лучший ответ.

Если вас интересует конкретный случай изменения цвета, вы также можете взглянуть на Neri and Castrucci 1997 и Skold et al. 2012 .

Все еще не объясняет, почему мРНК транскрибирует один фрагмент ДНК, а не другой.
1) мРНК является результатом транскрипции, но не транскрибируется. 2) да, это так (см. Регуляция экспрессии генов). Можно было бы многое сказать о регуляции экспрессии генов, поэтому для получения дополнительной информации просто загляните на страницу Википедии или на вводный курс, такой как, например, Академия Хана.

Другим забавным примером является определенный тип моли, который жил в Западной Германии («Рурпотт») и других районах во время индустриализации. Его основной средой обитания являются березы, т.е. в основном кора белых деревьев. Так что раньше животное было белым с несколькими черными пятнами.

Когда-то в Рурпотте было ужасно много добычи угля, и в некоторых районах березы действительно почернели от всего загрязнения воздуха. Глядь, через какое-то время мотылек тоже почернел с белыми пятнами.

Как уже упоминалось, очевидно, что это просто базовая эволюция. Что хорошо в вашем и моем примере, так это то, что это очень прямая , четкая связь. Если животное явно выделяется из-за своего цвета, его часто убивают. Это не наоборот, когда слегка положительный уклон дает немного больше потомства, а четкий, прямой факт «будь красным (или белым) и попадись».

Результатом этого является то, что этот вид эволюции работает очень быстро . Это может иметь огромный эффект уже через одно или два поколения (очевидно). Таким образом, при таких резких изменениях окружающей среды, через несколько поколений белых мотыльков может не остаться буквально, тёмные тогда получают всю среду обитания для своих (т. ). Следовательно, этот вид эволюции — в отличие от других разработок, которые могут занять сотни или тысячи лет — очень заметен для людей.

Еще один забавный факт: после индустриализации наш воздух стал чистым, березы побелели, а мотыльков снова уничтожили , пока они снова не стали белыми. Бедные животные...

Источник: Эволюция перцовой моли . Интересно читать; все это не было тогда "очевидным" для людей, и можно найти и критику.

Изменение окраски может быть вызвано новыми мутациями или эпигенетическими изменениями (например, изменение рациона беременных грызунов может изменить окрас шерсти детенышей, https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC165709/ ). Если изменение носит эпигенетический характер, это означает, что схема образования нового цвета уже присутствовала в генах животного до того, как изменение цвета было вызвано у его потомства изменением окружающей среды. В случае с лягушками могло случиться так, что у красных лягушек были зеленые предки, которые развили способность переключать свой цвет между зеленым и красным в ответ на фактор окружающей среды (например, наличие определенной пищи).

Однако я не знаю, что имеет в виду комментатор Дэвид, говоря: «Цветовая адаптация не связана с изменениями в генах». Даже если изменение является эпигенетическим, оно все равно влияет на функционирование генов.

вступление

На самом деле есть по крайней мере три способа, которыми цвет лягушки может измениться, чтобы приспособиться к цвету окружающей среды. Я кратко объясню, как работают эти три, потому что из некоторых комментариев кажется, что между ними есть некоторая путаница, а также потому, что вопрос смешивает изменения в течение жизни отдельной лягушки с изменениями в геноме лягушки. Эти три категории могут быть более широко применены к вопросу о том, как животные приспосабливаются к окружающей среде.

Эволюция

  • Происходит в течение нескольких жизней лягушки
  • Включает изменения в генах
  • Наследуется потомством

Эволюция происходит посредством естественного отбора. Другие ответы, такие как ответ @iayork, объяснили этот механизм.

Генная экспрессия

  • Происходит в течение жизни лягушки
  • Геном лягушки не изменен, и изменения не передаются по наследству
  • То, как интерпретируется ген, меняется

Хотя гены организма не меняются в течение жизни, способ их экспрессии может измениться. Это может привести к изменению цвета кожи в зависимости от изменений окружающей среды. Это объясняется в разделе «Влияние окружающей среды на экспрессию генов» .

Это будет уже существующая реакция на определенный набор условий; таким образом, они «знают», на что им измениться, потому что реакция на изменение окружающей среды предопределена их генами.

То, как на экспрессию генов влияет окружающая среда, будет зависеть от конкретного рассматриваемого признака. Механизмы этого недостаточно изучены, по крайней мере, для некоторых признаков, как показано в разделе «Влияние света на экспрессию генов и биосинтез подофиллотоксина в культуре клеток Linum album» из публикации «Физиология и биохимия растений», том 56 (июль 2012 г., страницы 41-46).

Адаптация фона

  • Не затрагивает гены животного, за исключением случаев, когда каждый биологический механизм закодирован в генах.
  • может произойти быстро

Фоновая адаптация — это подход, используемый хамелеонами, но некоторые виды лягушек, а также различные рыбы и ракообразные также обладают этой способностью. По сути, можно изменить распределение пигментов в специализированных структурах кожи, чтобы изменить цвет животного.

По крайней мере, у некоторых видов этот процесс зависит от способности животного видеть, поэтому, вероятно, информация о том, какой цвет выбрать, передается через нервную систему. Статья Википедии о хроматофорах дает дополнительную информацию в разделе о фоновой адаптации .

Вывод

Изменения, описанные в примере, не могут быть результатом генетических изменений, поскольку они происходят в течение многих поколений, а не в течение одной жизни. Чтобы понять, как животные приспосабливаются к окружающей среде, важно отделить этот вид адаптации от более долгосрочной адаптации посредством естественного отбора.

При этих более быстрых изменениях цвета, на которые может измениться животное, уже закодированы в его генах. Одним из механизмов, с помощью которого изменения в окружающей среде могут быть переданы для физической адаптации, является нервная система.

TLDR:

  • Изменения в геноме животного не происходят в течение жизни человека, но естественный отбор в сочетании со случайными мутациями может вызвать изменения в течение нескольких поколений.
  • Немедленные изменения в ответ на окружающую среду, подобные изменениям у хамелеонов (и в меньшей степени у лягушек), вызваны не изменениями в экспрессии генов, а механизмами, встроенными в рассматриваемое животное.
  • В течение жизни животного интерпретация генов может меняться в зависимости от окружающей среды, но это также встроенный механизм, и эти изменения не передаются по наследству.

ДНК содержит утверждения «если-то», которые предписывают мРНК транскрибировать один фрагмент, а не другой. Я не микробиолог, поэтому я приукрашиваю здесь, но механизм транскрипции — это то, что позволяет строить белки, которые затем каким-то образом собираются в гормоны, ткани и различные жидкости, такие как слизь, желчь и т. д.

На самом деле вопрос в том, что запускает одну ветвь «если-то» по сравнению с другой? Температура оказывается одна: олени, например, половозрелы только осенью. Когда температура падает, они начинают вырабатывать высокие уровни половых гормонов, из-за чего у самцов вырастают рога и они дерутся друг с другом.

Восприятие цвета должно быть другим: хамелеоны и некоторые виды кальмаров — очень яркие примеры. Глаза содержат различные клетки, чувствительные к определенным длинам волн ( https://en.wikipedia.org/wiki/Color_vision ). Клетки передают сигналы в мозг, что должно каким-то образом привести к выработке гормонов, которые, в свою очередь, запускают клетки кожи.

Некоторое химическое вещество достигает мРНК в соответствующих клетках, что устанавливает переменные SeasonIsAutumn или environmentIsGreen в значение true, и у оленей начинают расти рога, а лягушки, хамелеоны и кальмары становятся зелеными.

Конечно, эти сигналы температуры или цвета будут воздействовать только на те виды, подвиды и полы, ДНК которых содержит соответствующее утверждение «если-то». У оленей, очевидно, нет функции switchColor, как и у лягушек, или нет функцииrowBigAntlers.

Я хотел бы начать свой ответ с того, что никогда не извиняюсь за то, что чего-то не знаю. Нечего стыдиться, и хорошо спрашивать о вещах, которых не знаешь! Это должно делать больше людей, и вас не должны за это критиковать.

Я хочу сначала обратиться к вашему примеру, так как я считаю, что есть некоторое (общее) недоразумение. Сценарий, который вы описали, является типом ламарковской эволюции, которая на самом деле была лучшей попыткой объяснить механизм эволюции до дарвинизма. Ламарк был великим биологом, и, хотя мы можем высмеивать его идеи, они были прогрессивными для того времени с доступной ему информацией! Как бы то ни было, идея Ламарка заключалась в том, что организмы могут изменяться в течение своей жизни, чтобы приспособиться к конкретной среде, а затем передавать эти изменения своим потомкам. Самый классический пример — длинная шея жирафа. Согласно ламаркистской мысли, жираф вытягивал шею, чтобы дотянуться до листьев высоко на деревьях, и передал эту только что вытянутую шею своему потомству (и, следовательно, у всех жирафов теперь длинные шеи).

Вот почему эта идея не работает:

Все организмы несут одномерный «код» в своей клетке (ячейках), который действует как рецепт «построения» этого организма вместе с характеристиками организма, составляющими их фенотип (включая цвет, который вы описываете). Чаще всего этот код «записывается» и хранится в виде ДНК, цепочки биомолекул, называемых нуклеиновыми кислотами. Информация считывается из этого кода с помощью сложного биологического молекулярного механизма и используется для формирования каждого аспекта организма и влияния этого организма на окружающую среду; то есть информация течет из кода в среду, а не наоборот (то есть: она не перемещается из среды обратно в гены). Я должен сказать, что есть исключения, известные как эпигенетика, которая, хотя и чрезвычайно интересна, выходит за рамки этого вопроса.

Вы можете представить это так: представьте, что у вас есть рецепт торта. Все инструкции по выпечке торта закодированы в виде одномерной последовательности букв на странице вашей кулинарной книги. Это код для приготовления торта. Вы читаете эти буквы, и ваш мозг интерпретирует их значение. Вы используете эту интерпретированную информацию для выполнения действий, необходимых для выпечки пирога. Теперь, когда торт готов, вы отрезаете от него кусочек. Конечно, процесс разрезания и удаления ломтика не передает информацию рецепту. Вы можете себе представить, если бы это произошло, следующий торт, который вы сделали бы по этому рецепту, был бы с уже удаленным кусочком!

Я хочу подчеркнуть здесь, что лягушка, несущая ген красного цвета, не может добровольно или спонтанно изменить свой цвет на зеленый, чтобы соответствовать окружающей среде. Нет обратной связи с генами лягушки из окружающей среды. Способность выполнять такое изменение должна быть закодирована в ДНК этой лягушки и, вероятно, быть частью сложного механизма, который развивался на протяжении миллионов лет. Например, у многих птиц брачное оперение меняет цвет в определенное время года, но это наследственный признак, отточенный действием естественного отбора на протяжении миллионов лет и не имеющий ничего общего с сознательным желанием птицы быть более привлекательный.

Пожалуйста, не путайте: окружающая среда организма (включая «генетическую среду», набор генов в генофонде), а также такие вещи, как среда обитания, хищники и т. д., являются факторами давления, которые движут эволюцией путем естественного отбора. В этом смысле существует обратная связь с окружающей средой, но она происходит в популяциях видов на протяжении многих поколений, а не в течение жизни отдельных организмов, и действует совершенно другими способами, чем те, которые воображаются в рамках ламаркистской эволюции.

Это большая тема, и я мог бы продолжать и продолжать, но я надеюсь, что на данный момент это достаточный ответ на ваш конкретный вопрос. Я рекомендую вам ознакомиться с чрезвычайно увлекательной и познавательной книгой прославленного Ричарда Докинза «Слепой часовщик». Мой пример торта был взят из этой замечательной книги, и есть еще много других источников!