Почему протеины для суши называются «суши»? Каковы истоки этого имени?

Кто-нибудь знает, почему белки контроля комплемента (также короткие консенсусные повторы) называются «суши» белками? Есть ли какая-то особая причина для их имени?

Привет Добро пожаловать в Bio.SE. В вашем вопросе может быть немного больше контекста, чтобы продемонстрировать, что вы пытались ответить на него самостоятельно. Мы всегда просим запрашивающего предоставить доказательства предшествующих исследований. Смотрите здесь . Спасибо.
Люди, которые открывают что-то, получают небольшое вознаграждение в том, что могут назвать это как угодно в разумных пределах. Есть мотылек с волосами, как у Дональда Трампа, который был назван в его честь, и у некоторых белков есть невероятные имена (в настоящее время я изумлен белком звукового ежа ). Иногда — через некоторое время — имена меняются, если они особенно нелепы. Иногда нет ( люциферин — яркий образный пример).
@anon Биологи, в частности, любят быть умными / творческими в том, как они называют вещи, но это доставило им небольшие проблемы в области биомедицины. Оказывается, когда у пациентов есть какое-то изматывающее заболевание, не особенно хорошо проходит, когда врач начинает пытаться объяснить семье, что вызывает болезнь, и замешан какой-то белок или ген со забавным названием. Были попытки изменить некоторые настоящие остроты, которые чаще всего возникают в клинических случаях, но мешала инерция (плюс некоторое сопротивление со стороны тех из нас, у кого есть чувство юмора).
@CodyGray - Ага. Слежу за полемикой вокруг звукового ежа и лично считаю, что из уважения к разрушительной болезни, с которой он связан, его следует изменить. Но я мог бы чувствовать себя по-другому, если бы я был вовлеченным биологом. Однако в данном случае... Я бы не назвал его звуковым.
@anon О, вы упомянули Sonic Hedgehog, но я не знал, что вы уже знали о спорах вокруг него. Однако причина «Соника» в том, что это на самом деле четвертый белок в классе белков, формирующих паттерны развития. Остальные названы в честь настоящих видов ежей: индийского ежа, пустынного ежа и лунного ежа. Так что это не похоже на то, что кто-то просто вытащил имя из ниоткуда. Никто никогда не говорит об этом, но я не думаю, что пострадавшие почувствовали бы себя намного лучше, если бы им сказали, что у них есть дефект в их гене ежа лунной крысы. :-)
@CodyGray - :) Спасибо. Я понимаю естественное прогрессирование, но знание болезни, связанной с ним, имеет (или должно, imo) иметь некоторое отношение к названию. Например, если бы существовала группа белков, называемых «белками-кемперами», которые вызывали серьезные умственные отклонения, я бы не хотел видеть один из них, названный « счастливым кемпером », как бы это ни было смешно. Но, это не в моих руках, я рад сказать.
@anongoognurse Я считаю, что название предшествовало открытию болезней, которые оно вызвало.
Обратите внимание, что большинство (все?) этих названий получены в результате экспериментов с дрозофилами. Другой вопрос, что человеческие гомологи сохранили одно и то же имя. И если вы думаете, что Соник плохой, подумайте о семилессе , сыне семилесса , барахле (JNK) и шмаке , матери против декапентаплегии (безумие), список можно продолжить. Дрозофилы какие-то странные :P
@anongoodnurse: я думаю, вы ошибаетесь в источнике названия «люциферин». Это от латинского слова «несущий свет», и только (как бы) случайно это также имя фигуры дьявола из христианской мифологии.
@terdon - Вау, я понятия не имел, насколько... необычными могут быть некоторые из этих имен.
@jamesqf - Пожалуйста, не поймите меня неправильно; Мне нравится название «люциферин», и оно всегда было с самого начала. Я восхищаюсь остроумием (Уайльд, Бернс, Поуп и т. д.) и хотел бы иметь его побольше. Но меня бы удивило, если бы исследователи, назвавшие его, не обратили внимания на имя мифологического падшего ангела.
@anongoodnurse: Не забывая, нет, но и не ссылаясь на это напрямую. Назвать люминесцентный белок «носителем света» кажется очевидным. См. также «люцифераза» и помните, что старым словом для общего соответствия было «люцифер».

Ответы (1)

Потому что их форма напомнила исследователям роллы суши ( Ichinose et al, 1990 ):

Эти повторы первоначально были названы структурами GP-I, потому что они были впервые идентифицированы в β 2 -гликопротеин I. В последнее время их называют короткими консенсусными повторами или структурами суши из-за их формы.

введите описание изображения здесь

Я подумал, что было бы неплохо добавить сюда цитату из статьи, объясняющую название словами авторов. Затем я понял, что статья, которую вы цитируете, является просто обзором, в котором утверждается, что «совсем недавно их называли… суши» . Следующее предложение является ссылкой на эту статью , но в ней никогда не используется слово суши. Мне любопытно, знаете ли вы, кто может быть первым автором, употребившим этот термин.
@CodyGray Без понятия. Многие из этих терминов входят в лексикон в лабораториях и на конференциях еще до того, как попадут в литературу.
Слухи о бесплатном алкоголе, предлагаемом на исследовательских конференциях, совершенно не соответствуют действительности. Я клянусь!
@terdon Ты собираешься не на те конференции, приятель;)
Отдельное спасибо @JackAidley, а также спасибо за все остальные комментарии. Я предположил, что объяснение будет относиться к форме белков, но не смог найти ни одного источника, в котором бы мне это сказали. Я также подумал, что это может быть связано с какой-то предысторией — мой собственный пример с предкомплексом Бётцингера — его название происходит от вина Бётцингер, подаваемого на симпозиуме в Гейдельберге, когда впервые было представлено открытие этой структуры. Вы никогда не можете быть на 100% уверены, когда речь идет о странных именах в науке и их происхождении. Примеров множество. Еще раз большое спасибо!
@Джек, может быть. Точно не помню, все как в тумане. ;)
Почему протеины для суши называются «суши»? Каковы истоки этого имени?
СпросиСетьПолитика конфиденциальности1y, 0v