Я физик и пытаюсь понять химию белка для небольшого проекта. В основном аминокислоты объединяются, образуя белки, и после формирования первичной структуры могут происходить некоторые химические модификации, такие как фосфорилирование или гликозилирование (посттрансляционная модификация). В случае фермента карбоангидразы ион цинка добавляется посттрансляционно в качестве кофактора. (Последовательность аминокислот можно увидеть здесь (прокрутите вниз до заголовка «последовательность»).
Является ли присоединение цинка типом посттрансляционной модификации?
При денатурации карбоангидразы выделяется ли ион цинка в среду?
Изменится ли аминокислотная последовательность (первичная структура) после денатурации? Если да, удаляются ли аминокислоты после денатурации, если да, то какие?
Я предполагаю, что цинк будет удален после денатурации. Является ли оставшаяся структура первичной структурой белка?
1) Является ли присоединение цинка типом посттрансляционной модификации?
На самом деле это не считается посттрансляционной модификацией, потому что атом цинка не связан ковалентно с белком. Связывание с цинком адсорбционное.
2) При денатурации карбоангидразы выделяется ли ион цинка в среду?
Да, но это зависит и от степени денатурации. Ионы металлов можно удалить с помощью хелатирующих лигандов, таких как ЭДТА, без фактической денатурации белка.
3) Изменится ли аминокислотная последовательность (первичная структура) после денатурации? Если да, удаляются ли аминокислоты после денатурации, если да, то какие?
Денатурация не включает разрыв ковалентных связей. Последовательность аминокислот не изменится.
4) Я предполагаю, что цинк будет удален после денатурации. Является ли оставшаяся структура первичной структурой белка?
Да; только полипептид.
анепс
WYSIWYG