Я не могу найти четкого объяснения, что такое уровень экспрессии мРНК и как его измерить. Буду признателен, если кто-нибудь объяснит или даст ссылку.
Уровень экспрессии РНК — это оценка количества или пропорции РНК данного гена, обнаруженной в образце клеток (например, образце ткани) или даже в отдельной клетке.
Экспрессия используется потому, что последовательность РНК транслируется с ДНК на РНК в соответствии с сигналами внутри клеток.
Существуют различные способы оценки этого. Они часто включают специфичный для последовательности зонд - обычно короткую длину ДНК, - который будет специфически связываться с рассматриваемой РНК. Исключительность последовательности зонда, которая обычно имеет длину 20-45 оснований, по отношению к рассматриваемой РНК может варьироваться, и поэтому иногда это является чем-то вроде искусства.
Примерами являются КПЦР (количественная ПЦР), экспрессионные микрочипы . Обе эти технологии имеют множество разновидностей и вариантов.
Другая категория оценки экспрессии включает RNASeq, которая секвенирует все полимеры РНК в образце и одновременно оценивает все последовательности. Результат подобен микрочипу, но RNASeq не обязательно требует использования специфических зондов к РНК для ее измерения, хотя может.
Эти оценки обычно относительны, за исключением, возможно, тщательной количественной ПЦР. Цифры обычно не интерпретируются как «X копий РНК» в образце.
WYSIWYG