Какую информацию передает изображение микрочипа?

Хорошо, я читал, что клетка генерирует 4 вида цифровых (точнее, дискретных) данных, а именно ДНК, РНК, белок (последовательности, которые можно закодировать как строковые последовательности нуклеотидов/аминокислот) и изображение микрочипа. Я не биолог, но меня интересует статистика и теория информации этих данных. Я хотел бы знать, какую информацию передает изображение микрочипа ДНК? Например, после обработки с помощью подходящего программного обеспечения, какую информацию мы получаем?

Пример изображения микромассива:

введите описание изображения здесь

В общем случае цвет просто указывает, сколько конкретной РНК или ДНК содержится в вашем образце. То, что вы получите в результате, сильно зависит от конкретного эксперимента, который вы проводите.
Где я могу получить дополнительную информацию? Какова связь изображения микрочипа с экспрессией гена?
en.m.wikipedia.org/wiki/DNA_microarray В контексте эксперимента по уровню экспрессии каждое пятно представляет собой уникальный олигонуклеотидный зонд. Относительная интенсивность цвета каждого пятна говорит вам об относительном количестве РНК в клетке, которая гибридизуется с этим зондом.
Цвет обусловлен флуоресцентной меткой (Cy3/Cy5), прикрепленной к ДНК, которую вы гибридизуете с массивом.

Ответы (1)

Каждое пятно перекрывается с олигонуклеотидным зондом , предназначенным для идентификации определенной последовательности нуклеиновой кислоты. Массивы экспрессии генов имеют зонды, комплементарные последовательностям, полученным из экзонов; поэтому они будут гибридизоваться с этими последовательностями.

Перед гибридизацией кДНК (в данном случае) метят флуоресцентной молекулой, такой как Cy3 или Cy5 (для дифференциации обработанных и контрольных можно использовать два красителя). Обратите внимание, что в каждом пятне будет много молекул-зондов. Интенсивность флуоресценции пропорциональна количеству гибридизованных нитей ДНК, что, в свою очередь, пропорционально ее экспрессии в образце.

По анализу данных микрочипов доступно большое количество текстов, которые вы можете легко найти.

Какую информацию передает изображение микрочипа?
СпросиСетьПолитика конфиденциальности1y, 0v