Как дупликация генома челюстных позвоночных сделала возможной специализацию генов?

Сейчас я читаю главу 15 «Принципов жизни», 2-е издание:

Многие дупликации генов затрагивают только один или несколько генов одновременно, но в некоторых случаях могут дублироваться целые геномы. Когда все гены дублируются, появляются огромные возможности для развития новых функций. Похоже, именно это и произошло в ходе эволюции позвоночных. Геномы челюстных позвоночных имеют четыре диплоидных набора многих основных генов, что приводит биологов к выводу, что у предка этих видов произошло два события полногеномной дупликации. Эти дупликации сделали возможной значительную специализацию отдельных генов позвоночных, многие из которых в настоящее время очень тканеспецифичны в своей экспрессии.

У меня вопрос: как именно дублирование генома делает возможной специализацию генов? Другими словами, после того, как позвоночные подверглись дупликации генома, как одна копия генома стала «высокоспецифичной для ткани»?

Ответы (1)

В случае единственного гена мутации могут повлиять на некоторые жизненно важные функции и, следовательно, часто вредны и вызывают отрицательный отбор. Сразу же после события дупликации существует определенный уровень избыточности функции гена, и мутации в одной копии, приводящие к возникновению новых фенотипов, переносятся легче, поскольку наследственная функция сохраняется за паралогичным геном .

Некоторые материалы для чтения, если вы чувствуете себя так склонны:


Википедия:

Функциональное расхождение

Функциональная дивергенция — это процесс, при котором гены после дупликации меняют свою функцию от функции предков. Функциональная дивергенция может привести либо к субфункционализации, когда паралог специализируется на одной из нескольких наследственных функций, либо к неофункционализации, когда развивается совершенно новая функциональная способность.

Неофункционализация

После дупликации гена появляются две идентичные копии наследственного гена, выполняющие точно такую ​​же функцию. Эта избыточность позволяет одной из копий взять на себя новую функцию.

субфункционализация

Специализация — это уникальная модель субфункционализации, в которой паралоги делятся на различные области специализации, а не функции. В этой модели обе копии гена выполняют одну и ту же наследственную функцию. Например, в то время как предковый ген мог выполнять свою функцию во всех тканях, стадиях развития и условиях окружающей среды, паралогичные гены становятся специализированными, разделяясь между различными тканями, стадиями развития и условиями окружающей среды.


Крючкова-Мостаччи Н., Робинсон-Рехави М. 2016. Тканеспецифичность экспрессии генов медленно различается между ортологами и быстро между паралогами. PLoS Comput Biol 12:e1005274.

Наиболее широко распространенная модель состоит в том, что ортологи расходятся медленнее, а образование паралогов путем дублирования приводит к сильному расхождению и даже изменению функции.


Сориа П.С., МакГэри К.Л., Рокас А. 2014. Функциональное расхождение для каждого паралога. Мол Биол Эвол 31:984-992.

Поскольку гены могут быть ограничены отбором более чем на одном фенотипическом уровне, ослабление ограничений после дупликации генов делает возможной функциональную дивергенцию (FD) по нескольким фенотипическим осям.