Известно, что два белка, которые я исследую, взаимодействуют. Тем не менее, я хотел бы знать, взаимодействуют ли они также с другими белками и, возможно, образуют путь. Какие аналитические методы я должен использовать, чтобы определить это, если я уже сделал все анализы in silico ? Любое предложение приветствуется.
В своих исследованиях я использую нематоды C. elegans , и РНК-интерференция не подходит, так как я уже проводила ее.
Существует множество методов, которые можно использовать. Вот обзор и справочная информация о некоторых распространенных методах, написанных ThermoFisher:
Существует также фаговый дисплей, если вы хотите найти партнеров по связыванию, что является очень интересным методом для сужения количества партнеров по связыванию из всего интерактома. Его просто настроить в лаборатории, и вы можете выполнить все это в 96-луночном планшете, используя ELISA и несколько раундов селекции фагов. И, конечно же, существуют также, например, дрожжевой 2-гибрид (Y2H) или ко-иммунопреципитация (Co-IP).
МэттДмо
Your questions should be reasonably scoped. If you can imagine an entire book that answers your question, you’re asking too much.Область белок-белковых взаимодействий довольно широка, и существует множество методов, которые следует учитывать. Здесь не место перечислять их все.