Как располагались гены до развития биоинформатики?

Я хотел бы узнать подробную процедуру того, как ученые в прежние времена смогли определить местонахождение генов, подобно тому, как мы смогли определить местонахождение гена Хантингтона в 1983 году?

Не могли бы вы пояснить, что вы имеете в виду под более ранним временем, вы спрашиваете, как был расположен синдром Хантингтона или раньше, и в каком организме? И при чем тут, по-вашему, биоинформатика? Какие исследования вы провели, чтобы найти ответ, и почему бы вам не начать свой заголовок с заглавной буквы, как почти все остальные, и не проверить орфографию, если английский не является вашим родным языком.
Подробная процедура того, как ученые определили местонахождение гена гентингтина, охватывает не менее десяти лет и включает в себя несколько статей, поэтому ваш вопрос кажется довольно широким. Он был картирован на хромосоме 4 в 1983 году , но полная ORF с CAG-повторами не была идентифицирована до 1993 года .
Ваш вопрос также широк в том смысле, что для разных генов часто использовались разные методы. См. этот ответ для очень краткого описания того, как был открыт ген инсулина.

Ответы (2)

Самые ранние карты генома были построены из Escherichia coli путем злоупотребления конъюгацией специальных Hfr-мутантов. Я предполагаю, что вы немного знакомы с бактериальной конъюгацией — процессом переноса генетического материала между бактериальными клетками.

Обычно переносят только мобильные плазмиды. Они несут необходимые трагены для построения полового пилуса, системы репликации и переноса. Им также нужен oriT -сайт (источник передачи), на котором инициируется передача. Известной мобильной плазмидой является F-плазмида .

Некоторые мутантные клетки интегрировали F-плазмиду в свою основную хромосому посредством рекомбинации. Таким образом, они способны перенести весь свой геном в реципиентную клетку. Эти штаммы называются Hfr-штаммами (высокая частота рекомбинации), и они интенсивно использовались при картировании раннего генома.

Они обнаружили, что штамму Hfr требуется примерно 100 минут, чтобы перенести весь свой геном в другую клетку. Путем прерывания конъюгации (например, энергичным встряхиванием) перенос прерывался, и геном мог быть разделен на секции по времени переноса (10 мин, 20 мин, 30 мин и т. д.).

Функцию генов (или участков генома) выявляли путем скрещивания штаммов Hfr с дефектными мутантами. Если мутант не мог расти, например, на сахарозе, проводили несколько экспериментов по конъюгации с разным временем спаривания. Когда мутант после спаривания снова мог расти на сахарозе, проверяли время переноса. Если штамм был способен снова расти после 30 минут конъюгации, но не после 20, они знали, что гены, необходимые для роста сахарозы, находятся в 20-30-минутной области.

Потребовалось кропотливое количество экспериментов с широким спектром мутантов, чтобы построить первую карту генов E. coli , но это было сделано еще до того, как были известны даже последовательности нуклеотидов.

Просто в дополнение к Пифагиру.

Секвенирование и биоинформатика уже существовали в 1983 году, фактически Фредерик Сэнгер и его коллеги опубликовали свой автоматизированный метод секвенирования (секвенирование по Сэнгеру) в 1977 году. Они опубликовали полную последовательность бактериофага φX174. Другие методы секвенирования ДНК существовали с тех пор, как в 1970 году Рэй Ву изобрел первый.

Как располагались гены до развития биоинформатики?
СпросиСетьПолитика конфиденциальности1y, 0v