Какие примеры генов кодируют несколько белков?

Название в значительной степени говорит само за себя. Широко распространено мнение, что ген в эукариотической системе может продуцировать более одного белка благодаря посттранскрипционной модификации, но я не думаю, что встречал какие-либо конкретные примеры этого. Известны ли такие системы? Или это больше теоретически?

Самым популярным поисковым запросом Google по запросу «альтернативный сплайсинг» является статья в Википедии об альтернативном сплайсинге , которая включает несколько примеров. Я не могу себе представить, чтобы любой учебник, посвященный альтернативному сплайсингу, не содержал бы также примеров.
Вы говорите о посттранскрипционной модификации или имеете в виду альтернативный сплайсинг?

Ответы (3)

Существует множество способов получения варианта белка путем посттрансляционной модификации. Вопрос может показаться очевидным, но на самом деле он довольно широкий.

Я могу начать с этого. Сомневаюсь, что я знаю все способы, которыми одиночный транскрипт может продуцировать варианты белков. Подробное описание может быть больше похоже на обзорную статью, чем на ответ здесь.

Во-первых, очень редко встречаются эукариотические полицистронные мРНК : мРНК, кодирующие более одного белка. В этом случае после трансляции мРНК процессируются с образованием множественных моноцистронных РНК.

Затем есть белки с молекулами, присоединенными ковалентной связью к белку. Известно, что гликопротеины изменчивы. Многие другие небольшие молекулы могут быть связаны с белком, чтобы создать вариант такого рода: убиквитинизация, N-ацетилирование, домены SUMO, метилирование лизина — это лишь некоторые из наиболее распространенных ковалентных модификаций белков.

Существует редактирование РНК, при котором часть кодирующей РНК удаляется для создания альтернативного сплайсинга РНК.

У этого списка нет конца. Так приближается ли что-нибудь из этого к тому, что вы хотели знать?

Ответ не прост — @shigeta упомянул несколько механизмов, ведущих к отношениям между одним геном и несколькими белками, — и ответ, конечно, не короткий (таких генов тысячи).

Но в любом случае «альтернативный сплайсинг» кажется основным механизмом согласно этой статье , поэтому вместо того, чтобы перечислять все гены альтернативного сплайсинга, вот базы данных (+ ссылки):

База данных альтернативных генов сплайсинга (нажмите на синий для ссылки):

EDAS : база данных альтернативного сплайсинга, полученная из EST

U12DB : база данных сплайсосомных интронов U12.

FASTdb : Дружественная база данных альтернативного сплайсинга и транскриптов

BIPASS : конвейер биоинформатики для альтернативного сплайсинга

ASAP II : база данных альтернативного сплайсинга

ASTD : База данных альтернативного сплайсинга и разнообразия транскриптов

H-DBAS : База данных людей по альтернативному сплайсингу

Голливуд : база данных мРНК альтернативного сплайсинга

Ecgene : аннотация генома для альтернативного сплайсинга

SpliceMiner : коллекция сплайс-вариантов генов человека.

Просто для баланса, вот пример одного белка, конструируемого из продуктов двух первичных генов (два отдельных гена) посредством сплайсинга белков.