Изопреноиддифосфат (IPP) является важным метаболитом, который является предшественником многих вторичных метаболитов, таких как долихолдифосфат, убихинон, пренилированные белки и каротиноид (не синтезируется в serevisiae).
Какова средняя концентрация IPP в дрожжах на 1 г?
Хотя эта информация не дает прямого ответа на ваш вопрос, я надеюсь, что она закладывает основу для достижения метаболической инженерии IPP. Это также должно стать отправной точкой для дальнейшего изучения литературы.
Это довольно недавний обзор метаболической инженерии соответствующих путей в различных микробных системах, включая Saccaharmoyes :
Аджикумар П.К. и др . . (2008) Терпеноиды: возможности биосинтеза натуральных лекарственных препаратов с использованием сконструированных микроорганизмов. Молекулярная фармацевтика 5:167–190
Обзор относится к:
Ро, Д. и др. (2006) Производство предшественника противомалярийного препарата артемизиновой кислоты в искусственных дрожжах. Природа 440, 940–943.
В этой работе введение гена, специфичного для пути, привело к получению 4,4 мг л -1 продукта. Это было увеличено до 153 мг л -1 несколькими манипуляциями, включая:
Увеличение потока по пути за счет экспрессии модифицированной редуктазы HMG CoA
Снижение притока в синтез стеролов за счет подавления гена ERG9 в сочетании с экспрессией доминантно-негативного аллеля фактора транскрипции Upc2.
ОБНОВЛЯТЬ
После публикации моего ответа я нашел эту статью:
Хуанг, Б. и др. . (2011) Метаболитный целевой анализ изопреноидного пути в Saccharomyces cerevisiae в ответ на генетическую модификацию с помощью GC-SIM-MS в сочетании с хемометрией. Метаболомика 7: 134–146
Документ включает подробное обсуждение методологий, в которое я не буду вдаваться.
Хотя измерений ИПП нет, в табл. 7 представлен такой результат: геранилпирофосфат 32 нг/мл в 48-часовой культуре, А 600 ~ 2,3. Нарушение ERG9 увеличило это значение до 56 нг /мл.
Насколько я могу судить, эти значения представлены в виде нг мл -1 исходной культуры. Использование 1 ЕД OD600 соответствует 0,41 г сухих клеток на литр-1, взятому отсюда. Я вычислил значение GPP, равное 34 мкг / г сухого веса в штамме дикого типа.