Я наткнулся на онлайн-слайд биоинформатического алгоритма, где говорится, что угол Рамачандрана первой и последней аминокислоты не обязательно указывать все ее внутренние координаты. Неужели это не нужно для каких-либо симуляций при предсказании трехмерной структуры белков? Например, если у нас есть белковая цепь из N аминокислотной последовательности, будет 2N двугранных углов. Из которых нам нужно указать только 2N-2 (кроме первого и последнего двугранных углов аминокислоты) двугранных углов. Почему два угла игнорируются? Предположим, что все валентные углы и длины связей заданы для всей цепи.
Я видел это утверждение в следующем ppt, номер слайда -9, озаглавленное представление внутренних координат, под пунктом 3.
Рассмотрим случай цепочки из N=3 точек в пространстве. Есть только углы, связанные со средней точкой, две конечные точки не имеют связанных с ними углов, потому что у них есть только один инцидентный сегмент, а не два.
многослойный